Raderingsmappning

Inom genetik och särskilt genteknik är deletionskartläggning en teknik som används för att ta reda på mutationsställena i en gen .

Principen för deletionskartläggning involverar korsning av en stam som har en punktmutation i en gen, med flera stammar som var och en bär en deletion i en annan region av samma gen. Varhelst rekombination sker mellan de två stammarna för att producera en vildtypsgen (+) (oavsett frekvens), kan punktmutationen inte ligga inom området för deletionen. Om rekombination inte kan producera några vildtypsgener, är det rimligt att dra slutsatsen att punktmutationen och deletionen finns inom samma DNA- sträcka .

Detta exempel bör visa hur principen fungerar:

Anta att du har en gen X , som i vildtypsform (+) kan visas linjärt så här:

5'------------------------------------------------- -------------------------------------------------- ------------------3' gen X, +

Anta att en stam av organismer har en punktmutation i genen (nu kallad gen X, – för att ange att den inte längre är vildtyp):

5'------------------------------------------------- ----X--------------------------------------------- ------------------3' gen X, –

Anta nu att du har två stammar av organismer, var och en med deletioner i gen X på olika platser, kallade del-1 respektive del-2 (den streckade linjen indikerar borttagningsplatsen):

5'--------------------(................................ .................) ------------------------------------ ------------------3' del-1

5'------------------------------------------------ ------------(................................................ .......)---------3' del-2

Eftersom punktmutationen ligger inom deletionen av del-1 kommer det inte att finnas några vildtyps (+) rekombinanter mellan punktmutanten och del-1 mutanten. I en korsning mellan punktmutanten och del-2-mutanten kan det emellertid finnas en framgångsrik vildtyp (+) rekombinant som produceras.

Vid genetisk rekombination, om en mutant allel i donatorn är inom sekvensen som motsvarar regionen deleterad i mottagaren, kommer inga (+) rekombinanter att erhållas (som i korsningen med del-1). För att reparera en deletion genom rekombination måste donatorn ha vildtyps-DNA-sekvens i den region som motsvarar det DNA som deleterats i mottagaren (som i korsningen mot del-2). Med andra ord finns det en möjlig rekombinationsmöjlighet mellan punktmutanten och del-2 där en längd av DNA kunde göras som varken innehöll punktmutationen eller deletionen, vilket indikerar att mutationerna i dessa två stammar inte kan finnas i samma region.

Observera att inte alla korsningar mellan punktmutanten och del-2 kommer att ge (+) rekombinanter; i detta fall skulle endast de korsningshändelser som inträffar mellan punktmutanten och 5'-änden av deletionen ärva vildtypssekvensen.