RNPS1

RNPS1
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, E5.1, RNA-bindande protein med serinrik domän 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	n/a
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

RNA-bindande protein med serinrik domän 1 är ett protein som hos människor kodas av RNPS1 -genen .

Fungera

Denna gen kodar för ett protein som är en del av ett multiproteinkomplex efter splitsning, exon junction-komplexet , involverat i både mRNA-kärnexport och mRNA-övervakning. mRNA-övervakning upptäcker exporterade mRNA med trunkerade öppna läsramar och initierar nonsens-medierad mRNA-nedbrytning (NMD). När translation slutar uppströms från den sista exon-exon-övergången, utlöser detta NMD att bryta ner mRNA som innehåller för tidigt stoppkodon. Detta protein binder till mRNA:t och förblir bundet efter kärnexport och fungerar som ett nukleocytoplasmatiskt skyttelprotein. Detta protein innehåller många serinrester. Två splitsningsvarianter har hittats för denna gen; båda varianterna kodar för samma protein.

Interaktioner

RNPS1 har visats interagera med SART3 och Pinin .

Vidare läsning

Burn TC, Connors TD, Van Raay TJ, Dackowski WR, Millholland JM, Klinger KW, Landes GM (juni 1996). "Generering av en transkriptionell karta för en 700-kb region som omger generna för sjukdomen polycystisk njursjukdom typ 1 (PKD1) och tuberös skleros typ 2 (TSC2) på human kromosom 16p3.3" . Genomforskning . 6 (6): 525–37. doi : 10.1101/gr.6.6.525 . PMID 8828041 .
Wilson KF, Fortes P, Singh US, Ohno M, Mattaj IW, Cerione RA (feb 1999). "Det nukleära cap-bindande komplexet är ett nytt mål för tillväxtfaktorreceptorkopplad signaltransduktion" . Journal of Biological Chemistry . 274 (7): 4166–73. doi : 10.1074/jbc.274.7.4166 . PMID 9933612 .
Mayeda A, Badolato J, Kobayashi R, Zhang MQ, Gardiner EM, Krainer AR (aug 1999). "Rening och karakterisering av human RNPS1: en allmän aktivator av pre-mRNA splitsning" . EMBO Journal . 18 (16): 4560–70. doi : 10.1093/emboj/18.16.4560 . PMC 1171530 . PMID 10449421 .
Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (dec 2000). "Spliceosomen deponerar flera proteiner 20-24 nukleotider uppströms om mRNA exon-exon-övergångar" . EMBO Journal . 19 (24): 6860–9. doi : 10.1093/emboj/19.24.6860 . PMC 305905 . PMID 11118221 .
Harada K, Yamada A, Yang D, Itoh K, Shichijo S (sep 2001). "Bindning av ett SART3-tumöravstötningsantigen till en pre-mRNA splitsningsfaktor RNPS1: en möjlig reglering av splitsning genom en komplexbildning" . International Journal of Cancer . 93 (5): 623–8. doi : 10.1002/ijc.1391 . PMID 11477570 . S2CID 24724555 .
Kim VN, Kataoka N, Dreyfuss G (sep 2001). "Roll för den nonsens-medierade sönderfallsfaktorn hUpf3 i det splitsningsberoende exon-exon-övergångskomplexet" . Vetenskap . 293 (5536): 1832–6. Bibcode : 2001Sci...293.1832K . doi : 10.1126/science.1062829 . PMID 11546873 . S2CID 12018200 .
Lykke-Andersen J, Shu MD, Steitz JA (sep 2001). "Kommunikation av positionen för exon-exon-övergångar till mRNA-övervakningsmaskineriet av proteinet RNPS1". Vetenskap . 293 (5536): 1836–9. Bibcode : 2001Sci...293.1836L . doi : 10.1126/science.1062786 . PMID 11546874 . S2CID 389385 .
Lejeune F, Ishigaki Y, Li X, Maquat LE (juli 2002). "Exonövergångskomplexet detekteras på CBP80-bundet men inte eIF4E-bundet mRNA i däggdjursceller: dynamik i mRNP-ombyggnad" . EMBO Journal . 21 (13): 3536–45. doi : 10.1093/emboj/cdf345 . PMC 126094 . PMID 12093754 .
McCracken S, Longman D, Johnstone IL, Cáceres JF, Blencowe BJ (november 2003). "En evolutionärt bevarad roll för SRm160 i 3'-ändbearbetning som fungerar oberoende av exonövergångskomplexbildning" . Journal of Biological Chemistry . 278 (45): 44153–60. doi : 10.1074/jbc.M306856200 . PMID 12944400 .
Li C, Lin RI, Lai MC, Ouyang P, Tarn WY (okt 2003). "Nuclear Pnn/DRS-protein binder till splitsade mRNPs och deltar i mRNA-bearbetning och export via interaktion med RNPS1" . Molekylär och cellulär biologi . 23 (20): 7363–76. doi : 10.1128/MCB.23.20.7363-7376.2003 . PMC 230327 . PMID 14517304 .
Kataoka N, Dreyfuss G (feb 2004). "Ett enkelt helcelllysatsystem för splitsning in vitro avslöjar en stegvis sammansättning av exon-exonövergångskomplexet" . Journal of Biological Chemistry . 279 (8): 7009–13. doi : 10.1074/jbc.M307692200 . PMID 14625303 .
Sakashita E, Tatsumi S, Werner D, Endo H, Mayeda A (feb 2004). "Human RNPS1 och dess associerade faktorer: en mångsidig alternativ pre-mRNA splitsningsregulator in vivo" . Molekylär och cellulär biologi . 24 (3): 1174–87. doi : 10.1128/MCB.24.3.1174-1187.2004 . PMC 321435 . PMID 14729963 .
Nott A, Le Hir H, Moore MJ (januari 2004). "Splitsning förbättrar translation i däggdjursceller: en ytterligare funktion av exonövergångskomplexet" . Gener & Utveckling . 18 (2): 210–22. doi : 10.1101/gad.1163204 . PMC 324426 . PMID 14752011 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (aug 2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (aug 2004) . "Proteomisk, funktionell och domänbaserad analys av in vivo 14-3-3-bindande proteiner involverade i cytoskelettreglering och cellulär organisation" . Aktuell biologi . 14 (16): 1436–50. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660 . S2CID 2371325 .

externa länkar

Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : Q15287 (RNA-bindande protein med serinrik domän 1) vid PDBe-KB .