RERE

För annan användning, se Rere .

RERE
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, ARG, ARP, ATN1L, DNB1, arginin-glutaminsyradipeptidupprepningar, NEDBEH
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Arginin-glutaminsyra dipeptid repeats protein är ett protein som hos människor kodas av RERE -genen .

Fungera

Denna gen kodar för en medlem av atrofinfamiljen av proteiner som innehåller arginin-glutaminsyra (RE) dipeptidupprepning. Det kodade proteinet samlokaliserar med en transkriptionsfaktor i kärnan, och dess överuttryck utlöser apoptos. Ett liknande protein i mus associerar med histondeacetylas och tros fungera som en transkriptionell co-repressor under embryonal utveckling. Nya rapporter indikerar också att RERE och dess Drosophila-homolog associerar med histonmetyltransferaser för att reglera genuttryck. Flera transkriptvarianter som kodar för olika isoformer har hittats för denna gen.

Interaktioner

RERE har visat sig interagera med ATN1 .

Vidare läsning

•    Wang L, Rajan H, Pitman JL, McKeown M, Tsai CC (mars 2006). "Histonecetylasassocierande Atrofinproteiner är nukleära receptor-corepressorer" . Gener & utveckling . 20 (5): 525–30. doi : 10.1101/gad.1393506 . PMC 1410805 . PMID 16481466 .
•    Wang L, Charroux B, Kerridge S, Tsai CC (juni 2008). "Atrophin rekryterar HDAC1/2 och G9a för att modifiera histon H3K9 och för att bestämma cellöden" . EMBO-rapporter . 9 (6): 555–62. doi : 10.1038/embor.2008.67 . PMC 2427389 . PMID 18451879 .
•   Seki N, Ohira M, Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Nakajima D, Nomura N, Ohara O (okt 1997). "Karakterisering av cDNA-kloner i storleksfraktionerade cDNA-bibliotek från mänsklig hjärna" . DNA-forskning . 4 (5): 345–9. doi : 10.1093/dnares/4.5.345 . PMID 9455484 .
•   Waerner T, Gardellin P, Pfizenmaier K, Weith A, Kraut N (april 2001). "Human RERE är lokaliserad till nukleär promyelocytisk leukemi onkogena domäner och förstärker apoptos". Celltillväxt & -differentiering . 12 (4): 201–10. PMID 11331249 .
•   Yi J, Kloeker S, Jensen CC, Bockholt S, Honda H, Hirai H, Beckerle MC (mars 2002). "Medlemmar av Zyxin-familjen av LIM-proteiner interagerar med medlemmar av p130Cas-familjen av signalgivare" . Journal of Biological Chemistry . 277 (11): 9580–9. doi : 10.1074/jbc.M106922200 . PMID 11782456 .
•   Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (juni 2002). "Uttryckt sekvenstagganalys av vuxen mänsklig lins för NEIBank-projektet: över 2000 icke-redundanta transkript, nya gener och splitsningsvarianter". Molekylär syn . 8 : 171–84. PMID 12107413 .
•   Tomarev SI, Wistow G, Raymond V, Dubois S, Malyukova I (juni 2003). "Genexpressionsprofil för det mänskliga trabekulära nätverket: NEIBank-sekvenstagganalys" . Undersökande oftalmologi & visuell vetenskap . 44 (6): 2588–96. doi : 10.1167/iovs.02-1099 . PMID 12766061 .
•    Zoltewicz JS, Stewart NJ, Leung R, Peterson AS (januari 2004). "Atrophin 2 rekryterar histondeacetylas och krävs för funktionen av flera signalcentra under musembryogenes" ( PDF) . Utveckling . 131 (1): 3–14. doi : 10.1242/dev.00908 . PMID 14645126 . S2CID 20498980 .
•    Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (aug 2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
•   Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, Hayashi K, Suzuki Y, Yamamoto J, Wakamatsu A, Kimura K, Sakamoto K, Hatano N, Kawai Y, Ishii S, Saito K, Kojima S, Sugiyama T, Ono T, Okano K , Yoshikawa Y, Aotsuka S, Sasaki N, Hattori A, Okumura K, Nagai K, Sugano S, Isogai T (2007). "Signalsekvens och nyckelordsfälla i silico för urval av fullängds humana cDNA som kodar för sekretion eller membranproteiner från oligokapslade cDNA-bibliotek" . DNA-forskning . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743 .
•    Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (januari 2006 ). "Diversifiering av transkriptionsmodulering: storskalig identifiering och karakterisering av förmodade alternativa promotorer av mänskliga gener" . Genomforskning . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
•    Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (maj 2006). "Ett protein-proteininteraktionsnätverk för mänskliga ärftliga ataxier och störningar av Purkinje-celldegeneration" . Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .
•    Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (november 2006). "Global, in vivo och platsspecifik fosforyleringsdynamik i signalnätverk" . Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .