RDBP

NELFE
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, D6S45, NELF-E, RD, RDBP, RDP, negativ förlängningsfaktor komplex medlem E
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Negativ förlängningsfaktor E är ett protein som hos människor kodas av RDBP -genen .

Fungera

Proteinet som kodas av denna gen är en del av ett komplex som kallas negativ förlängningsfaktor (NELF) som undertrycker RNA-polymeras II- transkriptförlängning. Detta protein har likhet med nukleära RNA-bindande proteiner; det har dock inte visats att detta protein binder RNA. Proteinet innehåller ett område med alternerande basiska och sura rester, till stor del arginin (R) och asparaginsyra (D). Genen lokaliseras till det stora histokompatibilitetskomplexet ( MHC klass III ) regionen på kromosom 6.

Interaktioner

RDBP har visat sig interagera med:

Vidare läsning

Yu CY (1999). "Molekylär genetik för det mänskliga MHC-komplementgenklustret". Experimentell och klinisk immunogenetik . 15 (4): 213–30. doi : 10.1159/000019075 . PMID 10072631 . S2CID 25061446 .
Stevens M, De Clercq E, Balzarini J (sep 2006). "Regleringen av HIV-1-transkription: molekylära mål för kemoterapeutisk intervention" . Medicinal Research Recensioner . 26 (5): 595–625. doi : 10.1002/med.20081 . PMC 7168390 . PMID 16838299 .
Surowy CS, Hoganson G, Gosink J, Strunk K, Spritz RA (juni 1990). "Det humana RD-proteinet är nära besläktat med nukleära RNA-bindande proteiner och har varit mycket konserverat". Gene . 90 (2): 299–302. doi : 10.1016/0378-1119(90)90194-V . PMID 2119325 .
Speiser PW, White PC (dec 1989). "Struktur av den mänskliga RD-genen: en mycket konserverad gen i klass III-regionen av det stora histokompatibilitetskomplexet". DNA . 8 (10): 745–51. doi : 10.1089/dna.1989.8.745 . PMID 2612324 .
Lévi-Strauss M, Carroll MC, Steinmetz M, Meo T (april 1988). "En tidigare oupptäckt MHC-gen med en ovanlig periodisk struktur". Vetenskap . 240 (4849): 201–4. Bibcode : 1988Sci...240..201L . doi : 10.1126/science.3353717 . PMID 3353717 .
Cheng J, Macon KJ, Volanakis JE (sep 1993). "cDNA-kloning och karakterisering av proteinet som kodas av RD, en gen belägen i klass III-regionen av det mänskliga stora histokompatibilitetskomplexet" . The Biochemical Journal . 294 (2): 589–93. doi : 10.1042/bj2940589 . PMC 1134496 . PMID 8373374 .
Lee SG, Song K (juni 1997). "Genomisk organisation av den mänskliga DDX13-genen belägen mellan RD och RP1 i klass III MHC-komplexet". Molekyler och celler . 7 (3): 414–8. PMID 9264031 .
Büssow K, Cahill D, Nietfeld W, Bancroft D, Scherzinger E, Lehrach H, Walter G (november 1998). "En metod för globalt proteinuttryck och antikroppsscreening på högdensitetsfilter av ett arrayat cDNA-bibliotek" . Nukleinsyraforskning . 26 (21): 5007–8. doi : 10.1093/nar/26.21.5007 . PMC 147919 . PMID 9776767 .
Yang Z, Shen L, Dangel AW, Wu LC, Yu CY (november 1998). "Fyra allmänt uttryckta gener, RD (D6S45)-SKI2W (SKIV2L)-DOM3Z-RP1 (D6S60E), finns mellan komplementkomponentgener faktor B och C4 i klass III-regionen av HLA". Genomik . 53 (3): 338–47. doi : 10.1006/geno.1998.5499 . PMID 9799600 .
Yamaguchi Y, Takagi T, Wada T, Yano K, Furuya A, Sugimoto S, Hasegawa J, Handa H (april 1999). "NELF, ett multisubunit-komplex som innehåller RD, samarbetar med DSIF för att undertrycka RNA-polymeras II-förlängning" . Cell . 97 (1): 41–51. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80713-8 . PMID 10199401 . S2CID 16855257 .
Ping YH, Rana TM (april 2001). "DSIF och NELF interagerar med RNA-polymeras II-förlängningskomplex och HIV-1 Tat stimulerar P-TEFb-medierad fosforylering av RNA-polymeras II och DSIF under transkriptionsförlängning" . Journal of Biological Chemistry . 276 (16): 12951–8. doi : 10.1074/jbc.M006130200 . PMID 11112772 .
Yamaguchi Y, Inukai N, Narita T, Wada T, Handa H (maj 2002). "Bevis på att negativ förlängningsfaktor undertrycker transkriptionsförlängning genom bindning till ett DRB-känslighetsinducerande faktor/RNA-polymeras II-komplex och RNA. " Molekylär och cellulär biologi . 22 (9): 2918–27. doi : 10.1128/MCB.22.9.2918-2927.2002 . PMC 133766 . PMID 11940650 .
Narita T, Yamaguchi Y, Yano K, Sugimoto S, Chanarat S, Wada T, Kim DK, Hasegawa J, Omori M, Inukai N, Endoh M, Yamada T, Handa H (mars 2003). "Human transkriptionsförlängningsfaktor NELF: identifiering av nya subenheter och rekonstitution av det funktionellt aktiva komplexet" . Molekylär och cellulär biologi . 23 (6): 1863–73. doi : 10.1128/MCB.23.6.1863-1873.2003 . PMC 149481 . PMID 12612062 .
Xie T, Rowen L, Aguado B, Ahearn ME, Madan A, Qin S, Campbell RD, Hood L (dec 2003). "Analys av det gentäta stora histokompatibilitetskomplexet klass III-regionen och dess jämförelse med mus" . Genomforskning . 13 (12): 2621–36. doi : 10.1101/gr.1736803 . PMC 403804 . PMID 14656967 .
Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (januari 2004). "Analys av ett tvåhybridsystem med hög genomströmning av jäst och dess användning för att förutsäga funktionen hos intracellulära proteiner som kodas inom den mänskliga MHC klass III-regionen". Genomik . 83 (1): 153–67. doi : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . PMID 14667819 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (aug 2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Aiyar SE, Sun JL, Blair AL, Moskaluk CA, Lu YZ, Ye QN, Yamaguchi Y, Mukherjee A, Ren DM, Handa H, Li R (sep 2004). "Dämpning av östrogenreceptor alfa-medierad transkription genom östrogenstimulerad rekrytering av en negativ förlängningsfaktor" . Gener & utveckling . 18 (17): 2134–46. doi : 10.1101/gad.1214104 . PMC 515291 . PMID 15342491 .

externa länkar

FactorBook NELFe