PreQ1-II riboswitch
| preQ1-II (pre queuosine) riboswitch | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av preQ1-II-
| |
| identifierare | |
| Symbol | preQ1-II |
| Alt. Symboler | COG4708 |
| Rfam | RF01054 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Cis-reg ; riboswitch |
| Domän(er) | Bakterie |
| SÅ | SO:0005836 |
| PDB- strukturer | PDBe |
PreQ1-II riboswitch bildar en klass av riboswitch som specifikt binder pre-queuosine 1 (PreQ 1 ), en föregångare till den modifierade nukleosid queuosine . De finns i vissa arter av Streptococcus och Lactococcus , och identifierades ursprungligen som en konserverad RNA-sekundär struktur som kallas "COG4708-motivet". Alla kända medlemmar av denna riboswitch-klass verkar kontrollera medlemmar av COG4708-gener. Dessa gener förutsägs koda för membranbundna proteiner och har föreslagits vara en transportör av preQ 1 , eller en relaterad metabolit, baserat på deras association med preQ 1 -bindande riboswitchar. PreQ1-II-riboswitchar har inga uppenbara likheter i sekvens eller struktur med preQ1-I-riboswitchar , en tidigare upptäckt klass av preQ1 - bindande riboswitchar. PreQ 1 ansluter sig således till S-adenosylmetionin som den andra metaboliten som finns, som är liganden av mer än en riboswitch-klass.
