Polonia Nowy Tomyśl grundades 1922 och har under mycket av sin historia tävlat i lägre regionala och amatörligor i Polen . Klubben fick först uppflyttning till seniorligasystemet 1958 och nådde III ligan , som då var en liga på tredje nivån i den polska fotbollspyramiden. Den upprepade denna prestation 1992, innan den drabbades av en rad nedflyttningar till de regionala ligorna på sjätte nivån. Under det 21:a århundradet har klubben gjort betydande framsteg i ligasystemet och uppnått uppflyttningar till IV-ligan (2004), III-ligan (2008) och II Liga Väst (2010).
Efter slutet av säsongen 2011–12 av IV-ligan Storpolen upplöstes laget. 2016 återaktiverades den under namnet Nowotomyska Akademia Piłkarska Polonia Nowy Tomyśl och gick med i Klasa A .
Prestationer
III Liga (Kuyavian-Pomeranian-Wielkopolska-regionen)
