Pleurotolysin
Pleurotolysin B- | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
identifierare | |||||||||||
Symbol | plyB | ||||||||||
Pfam | PF01823 | ||||||||||
InterPro | IPR020864 | ||||||||||
PROSITE | PS51412 | ||||||||||
TCDB | 1.C.97. | ||||||||||
|
Pleurotolysin ( TC# 1.C.97.1.1 ) , ett sfingomyelinspecifikt cytolysin . Dess A (17 kDa; Q8X1M9 ) och B (59 kDa; Q5W9E8 ) komponenter är sammansatta till ett transmembranporkomplex. Pleurotolysin Pore-Forming (Pleurotolysin) Family ( TC# 1.C.97 ) är en familj av porbildande proteiner som tillhör MACPF-superfamiljen .
Fungera
Proteiner med membranangreppskomplex/perforin (MACPF)-domäner har en mängd olika biologiska roller, inklusive försvar och attack, organismutveckling och cellvidhäftning och signalering. Fördelningen av dessa proteiner i svampar verkar vara begränsad till enbart vissa Pezizomycotina- och Basidiomycota -arter, i korrelation med aegerolysinerna ( PF06355 ). Dessa två proteingrupper sammanfaller i endast ett fåtal arter, och de fungerar som cytolytiska bikomponent-porbildande medel. Representativa proteiner inkluderar pleurotolysin B, som har en MACPF- domän, det aegerolysinliknande proteinet pleurotolysin A och det mycket liknande ostreolysin A ( TC# 1.C.97.3.2 ) som har renats från ostronsvamp ( Pleurotus ostreatus ). Dessa samverkar för att perforera naturliga och artificiella lipidmembran med högt kolesterol- och sfingomyelininnehåll. Komplexet har en 13-merisk rosettliknande struktur med en central lumen som är ~4-5 nm i diameter. Den öppnade transmembranporen är icke-selektivt permeabel för joner och mindre neutrala lösta ämnen och är en orsak till cytolys av kolloid-osmotisk typ.
Forskning
Sakurai et al. 2004 klonade komplementära och genomiska DNA som kodar för pleurotolysin och studerade porbildande egenskaper hos rekombinanta proteiner. Rekombinant pleurotolysin A som saknade det första metioninet renades som ett 17 kDa protein med sfingomyelinbindande aktivitet. cDNA för pleurotolysin B kodade för en prekursor bestående av 523 aminoacylrester, av vilka 48 N-terminala aminoacylrester saknades i naturligt pleurotolysin B. Mogna former och prekursorformer av pleurotolysin B uttrycktes som olösliga 59- och 63-kDa-proteiner, respektive. Även om varken rekombinant pleurotolysin A eller B ensamt var hemolytiskt aktiva vid högre koncentrationer på upp till 100 mg/ml, samlades de i samarbete till ett membranporkomplex på humana erytrocyter och lyserade cellen.
Homologer
I denna TC-familj ingår båda beståndsdelarna av pleurotolysin och ostreolysin (A och B) under TC#s 1.C.97.1.1 respektive 1.C.97.1.2 . Emellertid återfinns homologer av Pleurotolysin B under TC#s 1.C.97.1.3 - 1.C.97.1.9 medan homologer av Pleurotolysin A återfinns under TC#s 1.C.97.2.1 - 1.C. 97.2.4 och TC#s 1.C.97.3.1 - 1.C.97.3.8 . Pleurotolysiner A är inte homologa med Pleurotolysiner B. Medan vissa homologer är beroende av närvaron av båda beståndsdelarna för porbildning, som noterats för både pleurotolysin och ostreolysin, kan vissa homologer av både A och B bilda porer utan den andra. Medan Pleurotolysin B är i MACPF-superfamiljen (TC# 1.C.39) medan Pleurotolysin A är i Aegerolysin-superfamiljen.
Erylysin
Ett annat tvåkomponenthemolysin, erylysin A och B (EryA och EryB; TC# 1.C.97.1.2 ), isolerades från en ätbar svamp, Pleurotus eryngii . Hemolytisk aktivitet uppvisades endast av EryA- och EryB-blandningen.
Aegerolysin
Medan Pleurotolysin B är i MACPF-superfamiljen ( TC# 1.C.39 ), är Pleurotolysin A i Aegerolysin-superfamiljen. Flera medlemmar av Aegerolysin-familjen har använts som verktyg för att detektera och visualisera ceramidfosfoetanolamin , en viktig sfingolipid hos ryggradslösa djur men inte hos djur. Det kan vara avlägset besläktat med medlemmar av Equinatoxin-familjen ( TC# 1.C.38) .
Aegerolysinfamiljen består av flera bakteriella och eukaryota aegerolysinliknande proteiner. Det har visat sig att aegerolysin och ostreolysin uttrycks under bildandet av primordia och fruktkroppar och möjligen spelar en roll i den inledande fasen av svampfruktbildning. De bakteriella medlemmarna i denna familj uttrycks under sporulering. Ostreolysin är cytolytiskt till olika erytrocyter och tumörceller på grund av porbildning. Flera medlemmar av Aegerolysin-familjen har använts som verktyg för att detektera och visualisera ceramidfosfoetanolamin , en viktig sfingolipid hos ryggradslösa djur men inte hos djur. Det kan vara avlägset besläktat med medlemmar av Equinatoxin-familjen ( TC# 1.C.38) .
Från och med 20:02, 16 februari 2016 (UTC), är den här artikeln härledd helt eller delvis från Transporter Classification Database . Upphovsrättsinnehavaren har licensierat innehållet på ett sätt som tillåter återanvändning enligt CC BY-SA 3.0 och GFDL . Alla relevanta villkor måste följas. Originaltexten var på "1.C.97 The Pleurotolysin Pore-Forming (Pleurotolysin) Family"