PhenX Toolkit

PhenX Toolkit
Typ av webbplats
Innehållswebbplats _
Tillgänglig i engelsk
Ägare NHGRI
Skapad av RTI International
URL www .phenxtoolkit .org
Kommersiell Nej
Registrering Frivillig
Användare 3700+ registrerade, 1,6 miljoner+ besök
Lanserades 6 februari 2009 ( 2009-02-06 )
Nuvarande status Aktiva
Innehållslicens
Allmängods

PhenX Toolkit är en webbaserad katalog med högprioriterade åtgärder relaterade till komplexa sjukdomar, fenotypiska egenskaper och miljöexponering. Dessa åtgärder valdes ut av arbetsgrupper av experter med hjälp av en konsensusprocess. PhenX Toolkits uppdrag är att förse utredare med standardmätprotokoll för användning i genomisk, epidemiologisk, klinisk och translationell forskning. Användning av PhenX-mått underlättar att kombinera data från en mängd olika studier och gör det enkelt för utredare att utöka en studiedesign bortom det primära forskningsfokuset. Verktyget finansieras av National Human Genome Research Institute (NHGRI) vid National Institutes of Health (NIH) med samfinansiering av Office of the Director (OD), National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NINDS), och National Heart, Lung and Blood Institute (NHLBI). Kontinuerligt finansierat sedan 2007, PhenX har fått finansiering från en mängd olika NIH-institut, inklusive National Institute on Drug Abuse (NIDA), National Institute on Mental Health (NIMH), National Cancer Institute (NCI) och National Institute on Minority Hälsa och hälsoskillnader (NIMHD). PhenX Toolkit är tillgängligt för det vetenskapliga samfundet utan kostnad.

För genomomfattande associationsstudier (GWAS) och andra studier som involverar människor kan användningen av standardmått underlätta korsstudieanalyser. Sådana analyser jämför oberoende resultat för att validera resultat eller kombinera studier för att öka urvalsstorleken och den statistiska styrkan . Denna ökade kraft gör det möjligt att identifiera mer subtila och komplexa associationer såsom gen-gen och gen-miljö-interaktioner . PhenX är ett NIH Common Data Element (CDE) Repository-projekt och stöder NIH Strategic Plan for Data Science, som främjar FAIR-principer (dvs. Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) för att underlätta datadelning.

Under 2020 samarbetade PhenX med US NIH:s Public Health Emergency and Disaster Research Response Program (DR2) för att samla in och granska forskningsprotokoll för epidemiologer, kliniker och andra forskare som studerar COVID-19. Toolkit släppte sex specialsamlingar av protokoll för att främja användningen av CDE för forskning om covid-19 i oktober 2020.

Se även

externa länkar

  • [1] dbGaP
  • [2] NIH Common Data Elements (CDE) Repository