PathoPhenoDB
PathoPhenoDB är en biologisk databas . Databasen kopplar patogener till deras fenotyper med hjälp av flera databaser som NCBI, Human Disease Ontology Human Phenotype Ontology , Mammalian Phenotype Ontology, PubChem , SIDER och CARD . Patogen-sjukdomsföreningar samlades huvudsakligen genom CDC och sidan Lista över infektionssjukdomar på Wikipedia. Det sätt på vilket de tilldelade taxonomi var halvautomatiskt. Vid kartläggning mot NCBI Taxonomy, om patogenen inte var en exakt matchning, mappades den sedan till moderklassen. PathoPhenoDB använder NPMI för att filtrera par baserat på deras samtidiga förekomststatistik.