PDCD6

PDCD6
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, ALG-2, PEF1B, ALG2, programmerad celldöd 6
externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	n/a
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Programmerad celldödsprotein 6 är ett protein som hos människor kodas av PDCD6 -genen .

Denna gen kodar för ett kalciumbindande protein som tillhör penta-EF-handproteinfamiljen. Kalciumbindning är viktig för homodimerisering och för konformationsförändringar som krävs för bindning till andra proteinpartners. Denna genprodukt deltar i T-cellsreceptor-, Fas- och glukokortikoid-inducerad programmerad celldöd. Hos möss med brist på denna genprodukt blockerades dock inte apoptos, vilket tyder på att denna genprodukt är funktionellt överflödig.

Interaktioner

PDCD6 har visats interagera med ASK1 , PDCD6IP , Fas-receptor , ANXA11 och PEF1 .

Vidare läsning

Krebs J, Klemenz R (2001). "ALG-2/AIP-komplexet, en modulator i gränssnittet mellan cellproliferation och celldöd? En hypotes" . Biochim. Biophys. Acta . 1498 (2–3): 153–61. doi : 10.1016/S0167-4889(00)00091-4 . PMID 11108958 .
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Vito P, Pellegrini L, Guiet C, D'Adamio L (1999). "Klonning av AIP1, ett nytt protein som associerar med den apoptos-kopplade genen ALG-2 i en Ca2+-beroende reaktion" . J. Biol. Chem . 274 (3): 1533–40. doi : 10.1074/jbc.274.3.1533 . PMID 9880530 .
Tarabykina S, Møller AL, Durussel I, et al. (2000). "Två former av det apoptoskopplade proteinet ALG-2 med olika Ca(2+)-affiniteter och måligenkänning" . J. Biol. Chem . 275 (14): 10514–8. doi : 10.1074/jbc.275.14.10514 . PMID 10744743 .
Chen B, Borinstein SC, Gillis J, et al. (2000). "Det gliomassocierade proteinet SETA interagerar med AIP1/Alix och ALG-2 och modulerar apoptos i astrocyter" . J. Biol. Chem . 275 (25): 19275–81. doi : 10.1074/jbc.M908994199 . PMID 10858458 .
Kitaura Y, Matsumoto S, Satoh H, et al. (2001). "Peflin och ALG-2, medlemmar av penta-EF-handproteinfamiljen, bildar en heterodimer som dissocierar på ett Ca2+-beroende sätt" . J. Biol. Chem . 276 (17): 14053–8. doi : 10.1074/jbc.M008649200 . PMID 11278427 .
Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I, et al. (2001). "Protein–Protein Interaction Panel Using Mouse Full-Length cDNAs" . Genome Res . 11 (10): 1758–65. doi : 10.1101/gr.180101 . PMC 311163 . PMID 11591653 .
Jung YS, Kim KS, Kim KD, et al. (2001). "Apoptos-kopplad gen 2 binder till Fas dödsdomän och dissocierar från Fas under Fas-medierad apoptos i Jurkat-celler". Biochem. Biophys. Res. Commun . 288 (2): 420–6. doi : 10.1006/bbrc.2001.5769 . PMID 11606059 .
Kitaura Y, Satoh H, Takahashi H, et al. (2002). "Både ALG-2 och peflin, penta-EF-hand (PEF) proteiner, stabiliseras genom dimerisering genom sina femte EF-hand regioner". Båge. Biochem. Biofys . 399 (1): 12–8. doi : 10.1006/abbi.2001.2736 . PMID 11883899 .
Satoh H, Shibata H, Nakano Y, et al. (2002). "ALG-2 interagerar med den aminoterminala domänen av annexin XI på ett Ca(2+)-beroende sätt". Biochem. Biophys. Res. Commun . 291 (5): 1166–72. doi : 10.1006/bbrc.2002.6600 . PMID 11883939 .
Chatellard-Causse C, Blot B, Cristina N, et al. (2002). "Alix (ALG-2-interagerande protein X), ett protein involverat i apoptos, binder till endofiliner och inducerar cytoplasmatisk vakuolisering" . J. Biol. Chem . 277 (32): 29108–15. doi : 10.1074/jbc.M204019200 . PMID 12034747 .
Hwang IS, Jung YS, Kim E (2002). "Interaktion av ALG-2 med ASK1 påverkar ASK1-lokalisering och efterföljande JNK-aktivering" . FEBS Lett . 529 (2–3): 183–7. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03329-X . PMID 12372597 . S2CID 9264865 .
Satoh H, Nakano Y, Shibata H, Maki M (2002). "Penta-EF-handdomänen av ALG-2 interagerar med aminoterminala domäner av både annexin VII och annexin XI på ett Ca2+-beroende sätt". Biochim. Biophys. Acta . 1600 (1–2): 61–7. doi : 10.1016/S1570-9639(02)00445-4 . PMID 12445460 .
Krebs J, Saremaslani P, Caduff R (2002). "ALG-2: ett Ca2+-bindande modulatorprotein involverat i cellproliferation och i celldöd". Biochim. Biophys. Acta . 1600 (1–2): 68–73. doi : 10.1016/S1570-9639(02)00446-6 . PMID 12445461 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Tomsig JL, Snyder SL, Creutz CE (2003). "Identifiering av mål för kalciumsignalering genom kopinfamiljen av proteiner. Karakterisering av ett coiled-coil-kopinbindande motiv" . J. Biol. Chem . 278 (12): 10048–54. doi : 10.1074/jbc.M212632200 . PMID 12522145 .
Hansen C, Tarabykina S, la Cour JM, et al. (2003). "PEF-familjens proteiner sorcin och grancalcin interagerar in vivo och in vitro" . FEBS Lett . 545 (2–3): 151–4. doi : 10.1016/S0014-5793(03)00518-0 . PMID 12804766 . S2CID 42572647 .

externa länkar

PDCD6 human genplacering i UCSC Genome Browser .
PDCD6 mänskliga gendetaljer i UCSC Genome Browser .