Nukleobindin 1

NUCB1
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CALNUC, NUC, nukleobindin 1
Externa ID
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Nucleobindin-1 (NUCB1), även känd som calnuc, är ett protein som hos människor kodas av NUCB1 -genen .

Strukturera

Det humana calnuc-proteinet innehåller 461 aminosyror och har ett pI på 4,9.

Proteinet innehåller följande regioner och domäner :

Signalpeptid
Leucin-dragkedja Leucin-dragkedjan i calnuc kan vara ansvarig för dess dimerisering.
aa 347-389 – Nukleär lokaliseringssignal
2 zinkbindningsställen med hög affinitet (Kd ₌ 20 nM)
karboxipeptidasliknande motiv: HFREXnH (aa 66) och HFTEXnH (aa 146)
2 EF-händer
Potentiell ankarregion – 15-aa hydrofob region vid dess COOH-terminal som kan vara tillräcklig för membranförankring

Vidare läsning

Miura K, Titani K, Kurosawa Y, Kanai Y (1992). "Molekylär kloning av nukleobindin, ett nytt DNA-bindande protein som innehåller både en signalpeptid och en leucin blixtlåsstruktur". Biochem. Biophys. Res. Commun . 187 (1): 375–80. doi : 10.1016/S0006-291X(05)81503-7 . PMID 1520323 .
Mochizuki N, Hibi M, Kanai Y, Insel PA (1995). "Interaktion av proteinet nukleobindin med G alfa i2, som avslöjats av jäst två-hybridsystemet" . FEBS Lett . 373 (2): 155–8. doi : 10.1016/0014-5793(95)01031-9 . PMID 7589456 . S2CID 84629575 .
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Ballif BA, Mincek NV, Barratt JT, et al. (1996). "Interaktion av cyklooxygenaser med ett apoptos- och autoimmunitetsassocierat protein" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (11): 5544–9. Bibcode : 1996PNAS...93.5544B . doi : 10.1073/pnas.93.11.5544 . PMC 39283 . PMID 8643612 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Kubota T, Miyauchi M, Miura K, et al. (1998). "Uppreglering av nukleobindinuttryck i humanaktiverade lymfocyter och non-Hodgkins lymfom". Patol. Int . 48 (1): 22–8. doi : 10.1111/j.1440-1827.1998.tb03823.x . PMID 9589460 . S2CID 20338800 .
Lin P, Le-Niculescu H, Hofmeister R, et al. (1998). "Det kalciumbindande proteinet från däggdjur, nukleobindin (CALNUC), är ett Golgi-resident protein" . J. Cell Biol . 141 (7): 1515–27. doi : 10.1083/jcb.141.7.1515 . PMC 2132997 . PMID 9647645 .
Taniguchi N, Taniura H, Niinobe M, et al. (2000). "Den postmitotiska tillväxtsuppressorn necdin interagerar med ett kalciumbindande protein (NEFA) i neuronal cytoplasma" . J. Biol. Chem . 275 (41): 31674–81. doi : 10.1074/jbc.M005103200 . PMID 10915798 .
Weiss TS, Chamberlain CE, Takeda T, et al. (2002). "Galpha i3 binder till calnuc på Golgi-membran i levande celler övervakas av fluorescensresonansenergiöverföring av grönt fluorescerande proteinfusionsproteiner" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (26): 14961–6. doi : 10.1073/pnas.261572098 . PMC 64966 . PMID 11752444 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
de Alba E, Tjandra N (2004). "Strukturella studier på Ca2+-bindande domän av humant nukleobindin (calnuc)". Biokemi . 43 (31): 10039–49. doi : 10.1021/bi049310a . PMID 15287731 .
Breuza L, Halbeisen R, Jenö P, et al. (2004). "Proteomics av endoplasmatisk reticulum-Golgi intermediate compartment (ERGIC) membran från brefeldin A-behandlade HepG2-celler identifierar ERGIC-32, ett nytt cykliskt protein som interagerar med humant Erv46" . J. Biol. Chem . 279 (45): 47242–53. doi : 10.1074/jbc.M406644200 . PMID 15308636 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Mot en proteomskalakarta över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket". Naturen . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Chen Y, Lin P, Qiu S, et al. (2007). "Autoantikroppar mot Ca2+-bindande protein Calnuc är en potentiell markör vid upptäckt av tjocktarmscancer" ( PDF) . Int. J. Oncol . 30 (5): 1137–44. doi : 10.3892/ijo.30.5.1137 . PMID 17390015 .
Tsukumo Y, Tomida A, Kitahara O, et al. (2007). "Nukleobindin 1 kontrollerar det oveckade proteinsvaret genom att hämma ATF6-aktivering" . J. Biol. Chem . 282 (40): 29264–72. doi : 10.1074/jbc.M705038200 . PMID 17686766 .