Nickelberoende hydrogenas
Nickelberoende | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
hydrogenasidentifierare | |||||||||||
Symbol | NiFeSe_Hases | ||||||||||
Pfam | PF00374 | ||||||||||
InterPro | IPR001501 | ||||||||||
PROSITE | PDOC00400 | ||||||||||
SCOP2 | 1frv / OMFATTNING / SUPFAM | ||||||||||
TCDB | 3.D.7 | ||||||||||
|
Hydrogenaser är enzymer som katalyserar den reversibla aktiveringen av väte och som förekommer i stor utsträckning i prokaryoter såväl som i vissa eukaryoter . Det finns olika typer av hydrogenaser, men alla verkar innehålla minst en järn-svavelkluster . De kan grovt delas in i två grupper: hydrogenaser som innehåller nickel och i vissa fall även selen ([NiFe]- och [NiFeSe]-hydrogenaserna) och de som saknar nickel ([Fe]-hydrogenaserna).
Hydrogenaserna [NiFe] och [NiFeSe] är heterodimerer som består av en liten subenhet som innehåller en signalpeptid och en stor subenhet. Alla kända stora subenheter verkar vara evolutionärt relaterade; de innehåller två Cys-xx-Cys-motiv; en vid deras N-terminala ände; den andra vid deras C-terminala ände. Dessa fyra cysteiner är involverade i bindningen av nickel. I [NiFeSe]-hydrogenaserna är det första cysteinet i det C-terminala motivet ett selenocystein som experimentellt har visats vara en nickelligand.