Multilocus genotyp

En multilocus genotyp är kombinationen av alleler som finns på två eller flera loci hos en enda individ.

Till exempel, i en diploid art, om det finns två SNP- locus och det första lokuset har alleler A och G, medan det andra lokuset har alleler T och C, kan multilocus-genotypen representeras som {A/G,T/C} . Om genomet inte är haploid så bestämmer inte multilocus-genotypen nödvändigtvis vilka alleler som förekommer samtidigt på kromosomerna. I exemplet, om de två loci är belägna på samma kromosom, är möjligheterna antingen {AT,GC} eller {AC,GT}. Där AT representerar en haplotyp med alleler A och T tillsammans på en kromosom och G och C tillsammans på den andra. Om haplotyperna bestäms kallas multilocus-genotypen till som en fasgenotyp, annars hänvisas till som opasad. Vissa författare föreslår att termen multilocus-genotyp endast bör tillämpas på fasad multilocus-data medan andra också tillämpar den på opasade multilocus-data. Kombinationen av alleler vid två eller flera loci på en enda kromosom utgör en haplotyp och de två haplotyperna hos en diploid individ utgör diplotypen (en synonym för en fasad multilocus-genotyp).