Mikroprocessorkomplex underenhet DGCR8

DGCR8
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, C22orf12, DGCRK6, Gy1, pasha, Pasha, DGCR8 mikroprocessorkomplex subenhet, mikroprocessorkomplex subenhet
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ; ; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Mikroprocessorkomplexsubenheten DGCR8 ( DiGeorges syndrom kritisk region 8) är ett protein som hos människor kodas av DGCR8 -genen . I andra djur, särskilt de vanliga modellorganismerna Drosophila melanogaster och Caenorhabditis elegans , är proteinet känt som Pasha (partner till Drosha ). Det är en nödvändig komponent i RNA-interferensvägen .

Fungera

Underenheten DGCR8 är lokaliserad till cellkärnan och krävs för bearbetning av mikroRNA (miRNA). Det binder till den andra underenheten Drosha , ett RNase III -enzym , för att bilda mikroprocessorkomplexet som klyver ett primärt transkript som kallas pri-miRNA till en karakteristisk stam-loop- struktur som kallas pre-miRNA, som sedan bearbetas vidare till miRNA-fragment av enzymet Dicer . DGCR8 innehåller en RNA -bindande domän och tros binda pri-miRNA för att stabilisera den för bearbetning av Drosha.

DGCR8 krävs också för vissa typer av DNA-reparation. Avlägsnande av UV-inducerade DNA- fotoprodukter , under transkriptionskopplad nukleotidexcisionsreparation (TC-NER), beror på JNK-fosforylering av DGCR8 på serin 153. Även om DGCR8 är känt för att fungera i mikroRNA-biogenes, krävs inte denna aktivitet för DGCR8-beroende avlägsnande av UV-inducerade fotoprodukter. Nukleotidexcisionsreparation behövs också för reparation av oxidativ DNA-skada på grund av väteperoxid ( H ₂ O ₂ ), och DGCR8-utarmade celler är känsliga för H ₂ O ₂ .

Vidare läsning

Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (sep 2000). "Systematisk subcellulär lokalisering av nya proteiner identifierade genom storskalig cDNA-sekvensering" . EMBO-rapporter . 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Shiohama A, Sasaki T, Noda S, Minoshima S, Shimizu N (april 2003). "Molekylär kloning och expressionsanalys av en ny gen DGCR8 belägen i DiGeorge syndromets kromosomala region". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 304 (1): 184–90. doi : 10.1016/S0006-291X(03)00554-0 . PMID 12705904 .
Gregory RI, Yan KP, Amuthan G, Chendrimada T, Doratotaj B, Cooch N, Shiekhattar R (november 2004). "Mikroprocessorkomplexet förmedlar tillkomsten av mikroRNA". Naturen . 432 (7014): 235–40. Bibcode : 2004Natur.432..235G . doi : 10.1038/nature03120 . PMID 15531877 . S2CID 4389261 .
Han J, Lee Y, Yeom KH, Kim YK, Jin H, Kim VN (dec 2004). "Drosha-DGCR8-komplexet i primär mikroRNA-bearbetning" . Gener & Utveckling . 18 (24): 3016–27. doi : 10.1101/gad.1262504 . PMC 535913 . PMID 15574589 .
Landthaler M, Yalcin A, Tuschl T (dec 2004). "Den humana DiGeorge syndromet kritiska region gen 8 och dess D. melanogaster homolog krävs för miRNA biogenes". Aktuell biologi . 14 (23): 2162–7. doi : 10.1016/j.cub.2004.11.001 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-EB83-3 . PMID 15589161 . S2CID 13266269 .
Han J, Lee Y, Yeom KH, Nam JW, Heo I, Rhee JK, Sohn SY, Cho Y, Zhang BT, Kim VN (juni 2006). "Molekylär grund för igenkännandet av primära mikroRNA av Drosha-DGCR8-komplexet" . Cell . 125 (5): 887–901. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.043 . PMID 16751099 .
Faller M, Matsunaga M, Yin S, Loo JA, Guo F (Jan 2007). "Heme är involverad i mikroRNA-bearbetning". Naturens strukturella & molekylära biologi . 14 (1): 23–9. doi : 10.1038/nsmb1182 . PMID 17159994 . S2CID 17463646 .
Sohn SY, Bae WJ, Kim JJ, Yeom KH, Kim VN, Cho Y (sep 2007). "Kristallstruktur av mänsklig DGCR8-kärna". Naturens strukturella & molekylära biologi . 14 (9): 847–53. doi : 10.1038/nsmb1294 . PMID 17704815 . S2CID 18561478 .