Melissa Händel

Melissa Anne Haendel
Haendel 2020
Alma mater	Reed College University of Wisconsin–Madison
Känd för	Bioinformatik
Vetenskaplig karriär
institutioner	Anschutz Medical Campus Oregon Health & Science University Oregon State University
Avhandling	Identifiering och karakterisering av den nya genen, axotropin, med hjälp av en in vitro genfälla förvalsmetod ( 1999)

Melissa Anne Haendel är en amerikansk bioinformatiker som är Chief Research Informatics Officer på Anschutz Medical Campus vid University of Colorado samt professor i biokemi och molekylär genetik och Marsico-stolen i datavetenskap. Hon fungerar som chef för Center for Data to Health (CD2H). Hennes forskning använder sig av data för att förbättra upptäckten och diagnosen av sjukdomar. Under covid-19-pandemin gick Haendel ihop med National Institutes of Health för att lansera National COVID Cohort Collaborative (N3C), som försöker identifiera riskfaktorer som kan förutsäga svårighetsgraden av sjukdomsutfallet och hjälpa till att identifiera behandlingar.

tidigt liv och utbildning

Haendel tog sin grundexamen i kemi vid Reed College . Hennes doktorsavhandling tittade på att designa läkemedel med hjälp av molekylära elektrostatiska potentialer (MEP) för att konstruera kvantitativa struktur-aktivitetsrelationer. Hon flyttade till University of Wisconsin–Madison för sina forskarstudier, där hon använde in vitro genfångning för att studera genen axotropin. Hennes tidiga karriär fokuserade på genetik och molekylärbiologi. År 2000 flyttade hon till University of Oregon som postdoktor och studerade sköldkörtelhormonernas roll i den neurala utvecklingen av zebrafisk .

Forskning och karriär

Haendel talar vid National Human Genome Research Institute 2016

Haendel började arbeta inom sjukvårdsinformatik 2004. Hon bytte fokus för sin forskning från neurovetenskap och zebrafiskens biologi till utvecklingen av resurser för Oregon Health & Science Universitys bibliotek. Hon befordrades till docent i medicinsk informatik 2015.

Haendels forskning tar hänsyn till ontologiutveckling, biokurering och dataharmonisering. Biocuration samlar information från patientjournaler, forskningsresultat och medicinsk litteratur för att skapa ett kvalitetskontrollerat, beräkningsbart format. Hon var tidigare chef för Translational Data Science vid Linus Pauling Institute . Hon innehar för närvarande positionen som Chief Research Informatics Officer vid University of Colorado Anschutz Medical Campus .

Haendel tror att en globalt konsekvent uppsättning kriterier, mer omfattande datainsamling, delning och analys kommer att hjälpa till att diagnostisera sällsynta sjukdomar. Sällsynta sjukdomar tros påverka 10 % av den globala befolkningen, vilket innebär att det finns ett stort antal patienter som är underbetjänade av deras sjukvårdssystem. Under 2019 tilldelades Haendel och CD2H nästan 9 miljoner dollar för att göra data relaterade till cancerforskning mer centraliserad och organiserad. Center for Cancer Data Harmonization använder sig av en molnbaserad portal för att dela data mellan läkare och cancerforskare över hela landet.

Under covid-19-pandemin hade USA inga standardiserade sätt att samla in och dela kliniska data . Haendel var orolig över att antalet dödsfall och infektioner inte räknades korrekt och att detta kunde äventyra säker återöppning. I juni 2020 bildade Haendel National COVID Cohort Collaborative (N3C), som sammanställer och analyserar journaldata för personer med coronavirussjukdom . N3C försöker identifiera riskfaktorer som kan förutsäga svårighetsgraden av koronavirussjukdomen och hjälpa till att identifiera potentiella behandlingar. Den har arbetsströmmar inom datapartnerskap, fenotyper, kollaborativ analys, dataharmonisering och datasyntes.

Utvalda publikationer

•      Mungall, Christopher J; Torniai, Carlo; Gkoutos, Georgios V; Lewis, Suzanna E; Haendel, Melissa A (2012). "Uberon, en integrativ multi-arts anatomi ontologi" . Genombiologi . 13 (1): R5. doi : 10.1186/gb-2012-13-1-r5 . ISSN 1465-6906 . PMC 3334586 . PMID 22293552 . S2CID 15453742 .
•    Day-Richter, J.; Harris, MA; Haendel, M.; Lewis, S. (2007-06-01). "OBO-Redigera en ontologiredaktör för biologer". Bioinformatik . 23 (16): 2198–2200. doi : 10.1093/bioinformatics/btm112 . ISSN 1367-4803 . PMID 17545183 .
•   Shimoyama, Mary; Dwinell, Melinda; Jacob, Howard (2009-08-05). "Flera ontologier för att integrera komplexa fenotypdatauppsättningar" . Naturens föregångar . doi : 10.1038/npre.2009.3554 . ISSN 1756-0357 .