MassTag-PCR

MassTag PCR är en modifiering av PCR baserad på masspektrometrisk detektion av en slutprodukt. Denna teknik togs fram av en vetenskapsman från Center for Infection and Immunity (CII) vid Mailman School of Public Health vid Columbia University , USA.

Principer

Liksom konventionell PCR använder MassTag-PCR primerpar . Skillnaden är att primrar som används för MassTag PCR är taggade med molekyler av kända massor eller MassCodes. Istället för ett par primrar använder denna teknik ett antal primers, vilket gör det till ett multiplexsystem. Till skillnad från konventionella Multiplex PCR-system, kunde i MassTag PCR mer än 15 primerpar användas. Om DNA från något av primerpanelens medel är närvarande kommer det att amplifieras. Varje förstärkt produkt kommer att ha sina specifika masskoder. PCR-produkten renas sedan för att avlägsna obundna primers, dNTPs, enzym och andra föroreningar. Slutligen utsätts de renade PCR-produkterna för UV -ljus eftersom den kemiska bindningen mellan nukleinsyrorna och primrarna är fotolabil . Eftersom masskoderna frigörs från PCR-produkter detekteras de med en masspektrometer. Närvaro av specifik MassCode indikerar närvaron av specifik patogen.

Ansökningar

Denna teknik har visat sig upptäcka en tidigare okarakteriserad kladd av rhinovirus . MassTag PCR är en mer omfattande och känslig diagnostisk teknik, CII kunde fastställa orsaken till denna sjukdom för 26 av 79 tidigare okända fall. MassTag PCR visade sitt trepartsvärde som ett verktyg för övervakning, upptäckt av utbrott och epidemiologi .