MassMatrix
MassMatrix är en masspektrometridataanalysmjukvara som använder en statistisk modell för att uppnå ökad massnoggrannhet jämfört med andra databassökningsalgoritmer . Denna sökmotor skiljer sig från andra på grund av dess förmåga att ge extremt effektiv bedömning mellan sanna och falska positiva resultat för data med hög massnoggrannhet som har erhållits från dagens masspektrometerinstrument. Det är användbart för att identifiera disulfidbindningar i tandemmasspektrometridata. Denna sökmotor skiljer sig från andra på grund av dess förmåga att ge extremt effektiv bedömning mellan sanna och falska positiva resultat för data med hög massnoggrannhet som har erhållits från dagens masspektrometerinstrument.
- ^ Xu H, Zhang L, Freitas MA (januari 2008). "Identifiering och karakterisering av disulfidbindningar i proteiner och peptider från tandem MS-data med hjälp av sökmotorn MassMatrix MS/MS" . Journal of Proteome Research . 7 (1): 138–44. doi : 10.1021/pr070363z . PMC 2749473 . PMID 18072732 .
- ^ Xu H, Freitas MA (juli 2008). "Monte carlo simuleringsbaserade algoritmer för analys av hagelgevärs proteomiska data" . Journal of Proteome Research . 7 (7): 2605–15. doi : 10.1021/pr800002u . PMC 2749500 . PMID 18543962 .
- ^ Xu, Hua; Hsu, Pang-Hung; Zhang, Liwen; Tsai, Ming-Daw; Freitas, Michael A. (2010-07-02). "Databassökningsalgoritm för identifiering av intakta korslänkar i proteiner och peptider med hjälp av tandemmasspektrometri" . Journal of Proteome Research . 9 (7): 3384–3393. doi : 10.1021/pr100369y . ISSN 1535-3893 . PMC 4141472 . PMID 20469931 .