Manuel Corpas (vetenskapsman)

Manuel Corpas
Porträtt av Manuel Corpas
Född	Manuel Corpas Lopez Malaga
Alma mater	Universitetet i Navarra
Känd för	Corpasome BioJS
Utmärkelser	Software Sustainability Institute 2016
Vetenskaplig karriär
Fält	Bioinformatik genomik
institutioner	Välkommen Sanger Institute Earlham Institute Cambridge Precisionsmedicin Universidad Internacional de La Rioja Institutet för fortbildning
Avhandling	Vikningsmönster i proteinsekvenser (2007)
Doktorand rådgivare	Terri Attwood
Hemsida	manuelcorpas .com www .cpm .onl www .ice .cam .ac .uk /om-oss /personalprofiler /tutor /dr-manuel-corpas www .unir .net /profesores /manuel-corpas /

Manuel Corpas är en anglo-spansk biolog och entreprenör som främst är känd för sina bidrag till området bioinformatik och genomik . Corpas är för närvarande Chief Scientist för Cambridge-startupen Cambridge Precision Medicine, en handledare vid Institutet för fortbildning vid University of Cambridge och en föreläsare vid Universidad Internacional de La Rioja . Manuel arbetade med det mänskliga genomet från början av sin karriär, och var en av de första konsumenterna som sekvenserade och sitt eget och nära släktingars genom, som han publicerade som Corpasome. Han har haft positioner vid Earlham Institute som projektledare och Wellcome Sanger Institute , och utvecklat databasen DECIPHER , en databas som hjälper till vid diagnos av patienter med sällsynta genomiska störningar.

Utbildning

Corpas tog sin kandidatexamen i biologi från University of Navarra 2000. Han tilldelades en doktorsexamen i bioinformatik 2007 av University of Manchester under ledning av professor Terri Attwood och Dr Steve Pettifer som studerade evolutionär bevarande av veck i proteiner .

Akademisk tjänst

Under sin doktorsexamen startade Corpas International Society for Computational Biology Student Council (ISCBSC), den internationella organisationen för beräkningsbiologistudenter. International Society for Computational Biology godkände officiellt studentrådet 2004 med Corpas som dess inledande ordförande. Hittills har studentrådet flera regionala studentgrupper runt om i världen som berör många tusentals studenter inom området. Corpas har också anordnat det första studentrådssymposiet i beräkningsbiologi vid European Conference in Computational Biology i Madrid (2005). Dessutom fungerade han som ordförande för den första konferensen för bioinformatik i Afrika av African Society for Bioinformatics and Computational Biology .

Forskning och karriär

Efter några månader på det spanska National Bioinformatics Institute i Madrid under Alfonso Valencia och European Bioinformatics Institute under Ewan Birney , bosatte sig Corpas på Wellcome Sanger Institute som utvecklare av DECIPHER-databasen under ledning av Dr Helen V. Firth. Sedan dess har han arbetat inom området mänsklig genomforskning och personlig genomik . Under sin tjänstgöringstid på Wellcome Sanger Institute fokuserade han initialt på utvecklingen av integrations- och visualiseringsverktyg för tolkning av datauppsättningar med kopianummervariationer. En stund senare började han sitt arbete i 'Corpasome'. Han var bland de första som offentliggjorde sin personliga genotyp från 23andMe på internet , och kallade processen "genombloggning". Strax efter analyserade hans familj sina genotyper med hjälp av 23andMe-data först och sedan mänsklig exome-teknologi och mer nyligen hela genomet. Detta har ledde till ett antal viktiga publikationer inom området personlig genomik, som utförde den första crowdsourced analysen av en familj av genom. Under slutet av sin tjänstgöringstid vid Sanger Institute organiserade han BioJavaScript (BioJS) community för att bli dess koordinator sedan 2012 fram till 2017. BioJS-gemenskapen är den största ansträngningen hittills i tillhandahållandet av webbkomponenter med öppen källkod för biologisk visualisering. Corpas forskargrupp har varit involverad i några av de viktigaste utvecklingarna av denna öppna mjukvarugemenskap. BioJS involverar insatser från världsledande resurser till exempel European Bioinformatics Institute , Berkeley Lab , Cambridge University m.fl. Corpas lyckades få 5 praktikplatser för Google Summer of Code , vilket gjorde att BioJS blev en internationell insats.

Corpas har också varit teknisk koordinator för ELIXIR-UK, den brittiska grenen av det europeiska nätverket ELIXIR för bioinformatik och dataresurser. Under sin tid som ELIXIR teknisk koordinator har han varit involverad i utvecklingen av bästa praxis och standardiserade mätvärden för att mäta effekten av dataresurser över hela Europa. Under denna tid var han också involverad i Global Organization for Bioinformatics Learning, Education and Training, som ordförande för deras tekniska kommitté och utvecklingen av deras utbildningsportal, som tillhandahåller utbildningsresurser med öppen tillgång för bioinformatikgemenskapen.

Förutom sitt arbete på Cambridge Precision Medicine är Manuel en handledare vid University of Cambridge Institute of Continuing Education och undervisar även onlinekurser i precisionsmedicin på både engelska och spanska. Manuel har över 50 peer reviewed vetenskapliga publikationer till sitt namn, och en bok Perfect DNA , där han utforskar de bredare frågorna bortom vetenskapen om genetisk sekvensering.

Utmärkelser och utmärkelser

Corpas är fellow vid Software Sustainability Institute och en frekvent talare i världsberömda evenemang inom genomik som Festival of Genomics London, BioData West, Longevity World Forum och andra. Han har katalogiserats som en av de ledande personerna från Málaga (Spanien) som har inflytande i världen.