ManA RNA-motiv
| manA RNA | |
|---|---|
 Konsensus sekundär struktur för manA RNA
| |
| Identifierare | |
| Symbol | manA RNA |
| Rfam | RF01745 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Cis -reglerande element |
| Domän(er) | Fotobakterie |
| PDB- strukturer | PDBe |
ManA . RNA-motivet (även kallat manA ) hänvisar till en konserverad RNA - struktur som identifierades av bioinformatik Förekomster av manA RNA-motivet upptäcktes i bakterier i släktet Photobacterium och fager som infekterar vissa typer av cyanobakterier . De flesta förutsagda manA- RNA-sekvenser härrör emellertid från DNA som samlats in från odlade marina bakterier . Nästan alla manA -RNA är placerade så att de kan vara i de 5'-otranslaterade regionerna av proteinkodande gener , och därför antogs det att manA -RNA fungerar som cis-regulatoriska element . Med tanke på den relativa komplexiteten hos deras sekundära struktur , och deras hypotetiska cis- reglerande roll, kan de vara riboswitchar .
Generna som tros regleras av manA RNA är oftast de som är involverade i metabolismen av sockerarterna fruktos och mannos , syntes av nukleotider , bakteriell fotosyntes och en klass av proteinförföljare som kallas ibpA . manA -RNA är också ofta intill transfer-RNA och transkriberas sannolikt med dem. Även om dessa gener inte anses vara typiska för fager, har det tidigare observerats att fager som infekterar cyanobakterier vanligtvis innehåller sådana gener.