LiveBänk
LiveBench är ett ständigt pågående benchmarkprojekt för att bedöma kvaliteten på förutsägelse av proteinstruktur och metoder för förutsägelse av sekundär struktur . LiveBench fokuserar huvudsakligen på homologimodellering och proteintrådning , men inkluderar också förutsägelse av sekundär struktur , som jämför offentligt tillgänglig webbserverutdata med nyligen deponerade proteinstrukturer i proteindatabanken . Liksom EVA- projektet och till skillnad från de relaterade CASP- och CAFASP -experimenten, är LiveBench avsedd att studera noggrannheten i förutsägelser som skulle erhållas av icke-experta användare av allmänt tillgängliga förutsägelsesmetoder. En stor fördel med LiveBench och EVA jämfört med CASP-projekt, som körs vartannat år, är deras jämförelsevis stora datamängd.
- Bujnicki JM, Elofsson A, Fischer D, Rychlewski L. (2001). LiveBench-1: kontinuerlig benchmarking av förutsägelseservrar för proteinstruktur. Protein Sci 10(2):352-61. PMID 11266621
- Rychlewski L, Fischer D. (2005). LiveBench-8: den storskaliga, kontinuerliga bedömningen av automatisk förutsägelse av proteinstruktur. Protein Sci 14(1):240-5. PMID 15608124