LIMS1

LIMS1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, PINCH, PINCH-1, PINCH1, LIM zinkfingerdomän som innehåller 1
externt ID
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS n/a
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

LIM och senescent cell antigenliknande-innehållande domänprotein 1 är ett protein som hos människor kodas av LIMS1 - genen .

Fungera

Proteinet som kodas av denna gen är ett adapterprotein som innehåller fem LIM-domäner, eller dubbla zinkfingrar. Proteinet är sannolikt involverat i integrinsignalering genom dess LIM-domänförmedlade interaktion med integrinkopplat kinas, som finns i fokala adhesionsplack. Det tros också fungera som en brygga som länkar integrinkopplat kinas till NCK-adapterprotein 2, som är involverat i signalvägar för tillväxtfaktorreceptorkinas. Dess lokalisering till periferin av spridande celler tyder också på att detta protein kan spela en roll i integrin-medierad cellvidhäftning eller spridning.

Interaktioner

LIMS1 har visats interagera med Integrin-kopplat kinas och NCK2 .

Vidare läsning

•    Tu Y, Li F, Wu C (1998). "Nck-2, ett nytt Src-homologi2/3-innehållande adapterprotein som interagerar med det LIM-bara proteinet PINCH och komponenter i tillväxtfaktorreceptorkinassignaleringsvägar" . Mol. Biol. Cell . 9 (12): 3367–82. doi : 10.1091/mbc.9.12.3367 . PMC 25640 . PMID 9843575 .
•   Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (1999). "Antigen som känns igen av autolog antikropp hos patienter med njurcellscancer" . Int. J. Cancer . 83 (4): 456–64. doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5 . PMID 10508479 .
•   Velyvis A, Yang Y, Wu C, Qin J (2001). "Lösningsstrukturen för den fokala adhesionsadaptern PINCH LIM1-domänen och karakterisering av dess interaktion med den integrinlänkade kinasankyrinrepeteringsdomänen" . J. Biol. Chem . 276 (7): 4932–9. doi : 10.1074/jbc.M007632200 . PMID 11078733 .
•    Tu Y, Huang Y, Zhang Y, Hua Y, Wu C (2001). "Ett nytt fokalt vidhäftningsprotein som interagerar med integrinkopplat kinas och reglerar cellvidhäftning och spridning" . J. Cell Biol . 153 (3): 585–98. doi : 10.1083/jcb.153.3.585 . PMC 2190577 . PMID 11331308 .
•   Zhang Y, Chen K, Tu Y, Velyvis A, Yang Y, Qin J, Wu C (2002). "Sammansättning av PINCH-ILK-CH-ILKBP-komplexet föregår och är väsentlig för lokalisering av varje komponent till cellmatrisvidhäftningsställen. " J. Cell Sci . 115 (Pt 24): 4777–86. doi : 10.1242/jcs.00166 . PMID 12432066 .
•    Campana WM, Myers RR, Rearden A (2003). "Identifiering av PINCH i Schwann-celler och DRG-neuroner: skyttel och signalering efter nervskada". Glia . 41 (3): 213–23. doi : 10.1002/glia.10138 . PMID 12528177 . S2CID 33508275 .
•    Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (2003). "Utforska proteomer och analysera proteinbearbetning genom masspektrometrisk identifiering av sorterade N-terminala peptider". Nat. Biotechnol . 21 (5): 566–9. doi : 10.1038/nbt810 . PMID 12665801 . S2CID 23783563 .
•    Velyvis A, Vaynberg J, Yang Y, Vinogradova O, Zhang Y, Wu C, Qin J (2003). "Strukturella och funktionella insikter i PINCH LIM4 domänförmedlad integrinsignalering". Nat. Struktur. Biol . 10 (7): 558–64. doi : 10.1038/nsb938 . PMID 12794636 . S2CID 175531 .
•   Fukuda T, Chen K, Shi X, Wu C (2003). "PINCH-1 är en obligatorisk partner för integrin-linked kinas (ILK) som fungerar i cellformmodulering, motilitet och överlevnad" . J. Biol. Chem . 278 (51): 51324–33. doi : 10.1074/jbc.M309122200 . PMID 14551191 .
•    Bock-Marquette I, Saxena A, White MD, Dimaio JM, Srivastava D (2004). "Tymosin beta4 aktiverar integrinkopplat kinas och främjar hjärtcellmigrering, överlevnad och hjärtreparation". Naturen . 432 (7016): 466–72. doi : 10.1038/nature03000 . PMID 15565145 . S2CID 4420896 .
•    Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, Bose R, Liu Z, Donovan RS, Shinjo F, Liu Y, Dembowy J, Taylor IW, Luga V, Przulj N, Robinson M, Suzuki H, Hayashizaki Y, Jurisica I, Wrana JL (2005). "High-throughput kartläggning av ett dynamiskt signalnätverk i däggdjursceller". Vetenskap . 307 (5715): 1621–5. Bibcode : 2005Sci...307.1621B . doi : 10.1126/science.1105776 . PMID 15761153 . S2CID 39457788 .
•   Dougherty GW, Chopp T, Qi SM, Cutler ML (2005). "Ras-dämparen Rsu-1 binder till LIM 5-domänen av adapterproteinet PINCH1 och deltar i adhesionsrelaterade funktioner". Exp. Cell Res . 306 (1): 168–79. doi : 10.1016/j.yexcr.2005.01.025 . PMID 15878342 .
•   Xu Z, Fukuda T, Li Y, Zha X, Qin J, Wu C (2005). "Molekylär dissektion av PINCH-1 avslöjar en mekanism för koppling och avkoppling av cellformsmodulering och överlevnad" . J. Biol. Chem . 280 (30): 27631–7. doi : 10.1074/jbc.M504189200 . PMID 15941716 .
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). "Mot en karta i proteomskala över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket". Naturen . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R .    doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .