LAGLIDADG RNA-motiv

LAGLIDADG-2
Konsensus sekundär struktur och sekvenskonservering av LAGLIDADG-2 RNA-
identifierare
Symbol	LAGLIDADG-2
Rfam	RF03094
Övriga uppgifter
RNA -typ	Gen ; sRNA
SÅ	SO:0001263
PDB- strukturer	PDBe

LAGLIDADG RNA-motiv är konserverade RNA- strukturer som upptäckts av bioinformatik . Dessa RNA-motiv är associerade med gener som kodar för endonukleaser av LAGLIDADG-varianten. Även om grupp I-introner ofta finns i självreplikerande element som använder LAGLIDADG-endonukleaser, verkar de kända LAGLIDADG-RNA-motiven för små och strukturellt enkla för att fungera som ett självsplitsande intron .

Ett LAGLIDADG-1-motiv-RNA förutsägs i svampen Trametes cingulata såväl som många metagenomiska sekvenser, som förmodligen härrör från andra svampar. LAGLIDADG-2-motiv-RNA finns i Halobacteria . Det är tvetydigt om LAGLIDADG-1 RNA fungerar som cis-regulatoriska element eller om de verkar i trans .