Klyvd amplifierad polymorf sekvens
Metoden med klyvd amplifierad polymorf sekvens ( CAPS ) är en teknik inom molekylärbiologi för analys av genetiska markörer . Det är en förlängning av (restriktion fragment length polymorphism) som använder polymeraskedjereaktion (PCR) för att snabbare analysera resultaten.
Liksom RFLP arbetar CAPS på principen att genetiska skillnader mellan individer kan skapa eller avskaffa restriktionsendonukleasrestriktionsställen , och att dessa skillnader kan detekteras i den resulterande DNA-fragmentlängden efter digestion.
I CAPS-metoden riktas PCR-amplifiering över det förändrade restriktionsstället och produkterna digereras med restriktionsenzymet. När de fraktioneras med agaros- eller polyakrylamidgelelektrofores kommer de digererade PCR-produkterna att ge lätt urskiljbara mönster av band. Alternativt kan det amplifierade segmentet analyseras med allelspecifika oligonukleotidsonder (ASO), en process som ofta kan göras med en enkel dot blot .
Se även
externa länkar