Kate R. Rosenbloom

Kate R. Rosenbloom är medlem i Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) Consortium. Hon är en teknisk projektledare och mjukvaruutvecklare vid Center for Biomolecular Science and Engineering, Jack Baskin School of Engineering , University of California Santa Cruz (UCSC), USA. Hon har varit medlem i den vetenskapliga rådgivande nämnden för det mänskliga proteomprojektet och bidragit med dataintegration och visualisering inom GTEx-konsortiet , ett internationellt projekt som syftar till att förstå hur genetisk variation formar variation mellan mänskliga vävnader.

Pilotstadiet av ENCODE , som involverade utveckling av en webbläsare för att visa experimentella resultat relaterade till regioner på den mänskliga genomsekvensen, genomfördes vid UCSC. Universitetsteamet underhåller och utvecklar UCSC Genome Browser för att ge allmänheten tillgång till genomdata från ett ökande antal djur, främst ryggradsdjur. Data som tillhandahålls av användaren kan också inkluderas. Det tillåter jämförelser och viss tolkning av uppgifterna. Webbläsaren släpptes första gången 2001 och en årlig uppdatering av utvecklingen publiceras varje januari.

Rosenbloom är författare eller medförfattare till över 35 publikationer, inklusive:

Jairo Navarro Gonzalez, Ann S Zweig, Matthew L Speir, Daniel Schmelter, Kate R Rosenbloom, Brian J Raney, Conner C Powell, Luis R Nassar, Nathan D Maulding, Christopher M Lee, Brian T Lee, Angie S Hinrichs, Alastair C Fyfe , Jason D Fernandes, Mark Diekhans, Hiram Clawson, Jonathan Casper, Anna Benet-Pagès, Galt P Barber, David Haussler, Robert M Kuhn, Maximilian Haeussler, W James Kent (2021) UCSC Genome Browser-databasen: 2021 uppdatering Nucleic Acids Research 49 Nummer D1, sidorna D1046–D1057
GTEx-konsortiet (2020) GTEx-konsortiets atlas över genetiska reglerande effekter över mänskliga vävnader. Science 369 1318-1330
Kate R. Rosenbloom, Cricket A. Sloan, Venkat S. Malladi, Timothy R. Dreszer, Katrina Learned, Vanessa M. Kirkup, Matthew C. Wong, Morgan Maddren, Ruihua Fang, Steven G. Heitner, Brian T. Lee, Galt P. Barber, Rachel A. Harte, Mark Diekhans, Jeffrey C. Long, Steven P. Wilder, Ann S. Zweig, Donna Karolchik, Robert M. Kuhn, David Haussler, W. James Kent (2012) ENCODE Data in the UCSC Genome Browser: uppdatering år 5. Nukleinsyraforskning 41 D56–D63