Proteinkodande gen i arten Homo sapiens
KPNB1
Tillgängliga strukturer
PDB
Ortologisk sökning:
Identifierare
, IMB1, IPO1, IPOB, Impnb, NTF97, karyopherin subunit beta 1
Externa IDs
Wikidata
Importin subenhet beta-1 är ett protein som hos människor kodas av KPNB1 -genen .
Fungera
Nukleocytoplasmatisk transport, en signal- och energiberoende process, sker genom nukleära porkomplex inbäddade i kärnhöljet. Importen av proteiner som innehåller en klassisk nukleär lokaliseringssignal (NLS) kräver NLS-importreceptorn, en heterodimer av importin alfa- och betasubenheter. Var och en av dessa underenheter är en del av karyoferinfamiljen av proteiner. Importin alfa binder den NLS-innehållande lasten i cytoplasman och importin beta dockar komplexet vid den cytoplasmatiska sidan av kärnporkomplexet. I närvaro av nukleosidtrifosfater och det lilla GTP-bindande proteinet Ran, flyttar komplexet in i kärnporkomplexet och importinsubenheterna dissocierar. Importin alfa kommer in i nukleoplasman med sitt passagerarprotein och importin beta finns kvar i poren. Interaktioner mellan importin beta och FG-upprepningarna av nukleoporiner är väsentliga vid translokation genom porkomplexet. Proteinet som kodas av denna gen är en medlem av importin beta-familjen.
Interaktioner
KPNB1 har visat sig interagera med:
KPNA3 ,
Karyopherin alfa 1 ,
Karyopherin alfa 2 ,
Mödrar mot dekapentaplegi homolog 3 ,
NUP153
NUP50 ,
NUP98 ,
Nukleoporin 62 ,
P53 ,
Paratyreoideahormonrelaterat protein ,
RANBP1 ,
RANBP2 ,
Ran (biologi) , och
SMN1 .
Vidare läsning
Bukrinsky MI, Haffar OK (1997). "HIV-1 kärnkraftsimport: på jakt efter en ledare". Främre. Biosci . 2 (4): d578–87. doi : 10.2741/A213 . PMID 9366553 .
Bukrinsky MI, Haffar OK (1998). "HIV-1 kärnkraftsimport: matrisprotein är tillbaka på scenen, denna gång tillsammans med Vpr" . Mol. Med . 4 (3): 138–43. doi : 10.1007/BF03401911 . PMC 2230352 . PMID 9562972 .
Christophe D, Christophe-Hobertus C, Pichon B (2000). "Nukleär inriktning av proteiner: hur många olika signaler?". Cell. Signal . 12 (5): 337–41. doi : 10.1016/S0898-6568(00)00077-2 . PMID 10822175 .
Chook YM, Blobel G (2001). "Karyoferiner och kärnkraftsimport". Curr. Opin. Struktur. Biol . 11 (6): 703–15. doi : 10.1016/S0959-440X(01)00264-0 . PMID 11751052 .
Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). "Roller av HIV-1 hjälpproteiner i viral patogenes och värd-patogen interaktioner" . Cell Res . 15 (11–12): 923–34. doi : 10.1038/sj.cr.7290370 . PMID 16354571 .
Bukrinsky MI, Sharova N, Dempsey MP, Stanwick TL, Bukrinskaya AG, Haggerty S, Stevenson M (1992). "Aktiv nukleär import av humant immunbristvirus typ 1 preintegrationskomplex" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 89 (14): 6580–4. Bibcode : 1992PNAS...89.6580B . doi : 10.1073/pnas.89.14.6580 . PMC 49545 . PMID 1631159 .
Bukrinsky MI, Haggerty S, Dempsey MP, Sharova N, Adzhubel A, Spitz L, Lewis P, Goldfarb D, Emerman M, Stevenson M (1993). "En nukleär lokaliseringssignal inom HIV-1 matrisprotein som styr infektion av icke-delande celler" . Naturen . 365 (6447): 666–9. Bibcode : 1993Natur.365..666B . doi : 10.1038/365666a0 . PMC 9524217 . PMID 8105392 . S2CID 25678 .
Lounsbury KM, Richards SA, Perlungher RR, Macara IG (1996). "Ran-bindande domäner främjar interaktionen av Ran med p97/beta-karyoferin, kopplar docknings- och translokationsstegen för kärnkraftsimport" . J. Biol. Chem . 271 (5): 2357–60. doi : 10.1074/jbc.271.5.2357 . PMID 8576188 .
Görlich D, Henklein P, Laskey RA, Hartmann E (1996). "Ett motiv på 41 aminosyror i importin-alfa ger bindning till importin-beta och därmed transit in i kärnan" . EMBO J . 15 (8): 1810–7. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00530.x . PMC 450097 . PMID 8617226 .
Weis K, Ryder U, Lamond AI (1996). "Den konserverade aminoterminala domänen av hSRP1 alfa är väsentlig för import av nukleärt protein" . EMBO J . 15 (8): 1818–25. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00531.x . PMC 450098 . PMID 8617227 .
Moroianu J, Blobel G, Radu A (1996). "Kärnproteinimport: Ran-GTP dissocierar karyoferin-alfabeta-heterodimeren genom att ersätta alfa från ett överlappande bindningsställe på beta" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (14): 7059–62. Bibcode : 1996PNAS...93.7059M . doi : 10.1073/pnas.93.14.7059 . PMC 38935 . PMID 8692944 .
Görlich D, Panté N, Kutay U, Aebi U, Bischoff FR (1996). "Identifiering av olika roller för RanGDP och RanGTP vid import av kärnprotein" . EMBO J . 15 (20): 5584–94. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00943.x . PMC 452303 . PMID 8896452 .
Chi NC, Adam EJ, Adam SA (1997). "Olika bindande domäner för Ran-GTP och Ran-GDP/RanBP1 på nukleär importfaktor p97" . J. Biol. Chem . 272 (10): 6818–22. doi : 10.1074/jbc.272.10.6818 . PMID 9045717 .
Percipalle P, Clarkson WD, Kent HM, Rhodes D, Stewart M (1997). "Molekylära interaktioner mellan importin alfa/beta-heterodimeren och proteiner involverade i import av ryggradsdjurs kärnprotein". J. Mol. Biol . 266 (4): 722–32. doi : 10.1006/jmbi.1996.0801 . PMID 9102465 .
Kutay U, Izaurralde E, Bischoff FR, Mattaj IW, Görlich D (1997). "Dominant-negativa mutanter av importin-beta blockerar flera vägar för import och export genom det nukleära porkomplexet" . EMBO J . 16 (6): 1153–63. doi : 10.1093/emboj/16.6.1153 . PMC 1169714 . PMID 9135132 .
Bonifaci N, Moroianu J, Radu A, Blobel G (1997). "Karyopherin beta2 förmedlar nukleär import av ett mRNA-bindande protein" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (10): 5055–60. Bibcode : 1997PNAS...94.5055B . doi : 10.1073/pnas.94.10.5055 . PMC 24630 . PMID 9144189 .
Görlich D, Dabrowski M, Bischoff FR, Kutay U, Bork P, Hartmann E, Prehn S, Izaurralde E (1997). "En ny klass av RanGTP-bindande proteiner" . J. Cell Biol . 138 (1): 65–80. doi : 10.1083/jcb.138.1.65 . PMC 2139951 . PMID 9214382 .
Tiganis T, Flint AJ, Adam SA, Tonks NK (1997). "Association av T-cellsproteinet tyrosinfosfatas med nukleär importfaktor p97" . J. Biol. Chem . 272 (34): 21548–57. doi : 10.1074/jbc.272.34.21548 . PMID 9261175 .
PDB galleri
1f59 : IMPORTIN-BETA-FXFG NUCLEOPORIN COMPLEX
1gcj : N-TERMINAL FRAGMENT AV IMPORTIN-BETA
1ibr : KOMPLEX AV KÖR MED IMPORTIN BETA
1m5n : Kristallstruktur av HEAT-repetitioner (1-11) av importin b bunden till den icke-klassiska NLS(67-94) av PTHrP
1o6o : IMPORTIN BETA AA1-442 BUNDEN TILL FEM FXFG REPEATS FRÅN JÄST NSP1P. ANDRA KRISTALLFORMEN
1o6p : IMPORTIN BETA BUNDEN TILL EN GLFG NUKLEOPORINPEPTID
1qgk : STRUKTUR AV IMPORTIN BETA BUNDEN TILL IBB-DOMÄNEN AV IMPORTIN ALPHA
1qgr : STRUKTUR AV IMPORTIN BETA BUNDEN TILL IBB-DOMÄNEN AV IMPORTIN ALPHA (II KRISTALLFORM, OVÄLDS TILL LÅG PH)
1ukl : Kristallstruktur av Importin-beta och SREBP-2-komplex