KARS (gen)

KARS1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, KARS2, CMTRIB, lysyl-tRNA-syntetas 1, KRS, Lysyl-tRNA-syntetas, KARS, DFNB89, LEPID, DEAPLE
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Lysyl-tRNA-syntetas är ett enzym som hos människor kodas av KARS -genen .

Fungera

Aminoacyl-tRNA-syntetaser är en klass av enzymer som laddar tRNA med sina besläktade aminosyror. Lysyl-tRNA-syntetas är en homodimer lokaliserad till cytoplasman som tillhör klass II-familjen av tRNA-syntetaser. Det har visat sig vara ett mål för autoantikroppar vid humana autoimmuna sjukdomar, polymyosit eller dermatomyosit

Förutom sin roll i translation är Lysyl-tRNA-syntetas involverad i en signalväg som leder till genaktivering. Efter fysiologisk stimulering av en mängd olika celler binder Lysyl-tRNA-syntetas till transkriptionsfaktorerna MITF och USF2 och kan sedan påverka deras transkriptionsaktiviteter. Sådan fysiologisk stimulering inkluderar immunologisk aktivering av mastceller, så denna väg kan vara relevant för det allergiska svaret.

Interaktioner

KARS (gen) har visats interagera med multisyntetaskomplexets hjälpkomponent p38 . Fysiologiska utlösare såsom immunologisk aktivering resulterar i fosforylering av LysRS på dess serinrester. Det separerar från multisyntetaskomplexet och initierar Ap4A- produktion.

Vidare läsning

•   Yannay-Cohen N, Razin E (okt 2006). "Översättning och transkription: den dubbla funktionaliteten av LysRS i mastceller". Molekyler och celler . 22 (2): 127–32. PMID 17085962 .
•    Carmi-Levy I, Yannay-Cohen N, Kay G, Razin E, Nechushtan H (sep 2008). "Diadenosin-tetrafosfathydrolas är en del av det transkriptionella regleringsnätverket i immunologiskt aktiverade mastceller" . Molekylär och cellulär biologi . 28 (18): 5777–84. doi : 10.1128/MCB.00106-08 . PMC 2546939 . PMID 18644867 .
•    Carmi-Levy I, Motzik A, Ofir-Birin Y, Yagil Z, Yang CM, Kemeny DM, Han JM, Kim S, Kay G, Nechushtan H, Suzuki R, Rivera J, Razin E (maj 2011). "Importin beta spelar en viktig roll i regleringen av LysRS-Ap(4)A-vägen i immunologiskt aktiverade mastceller" . Molekylär och cellulär biologi . 31 (10): 2111–21. doi : 10.1128/MCB.01159-10 . PMC 3133347 . PMID 21402779 .
•   Kleiman L, Halwani R, Javanbakht H (april 2004). "Den selektiva förpackningen och hybridiseringen av primern tRNALys3 i HIV-1". Aktuell HIV-forskning . 2 (2): 163–75. doi : 10.2174/1570162043484988 . PMID 15078180 .
•   Kino T, Pavlakis GN (april 2004). "Partnermolekyler av accessoriskt protein Vpr av humant immunbristvirus typ 1" . DNA och cellbiologi . 23 (4): 193–205. doi : 10.1089/104454904773819789 . PMID 15142377 .
•   Kleiman L, Cen S (sep 2004). "tRNALys förpackningskomplex i HIV-1". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology . 36 (9): 1776–86. doi : 10.1016/j.biocel.2004.02.022 . PMID 15183344 .
•   Norcum MT (aug 1991). "Strukturanalys av aminoacyl-tRNA-syntetaskomplexet med hög molekylvikt. Effekter av neutrala salter och tvättmedel" . Journal of Biological Chemistry . 266 (23): 15398–405. doi : 10.1016/S0021-9258(18)98629-1 . PMID 1651330 .
•   Nomura N, Nagase T, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Sato S, Seki N, Kawarabayasi Y, Ishikawa K, Tabata S (1995). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade humana gener. II. De kodande sekvenserna för 40 nya gener (KIAA0041-KIAA0080) härledd genom analys av cDNA-kloner från human cellinje KG-1" . DNA-forskning . 1 (5): 223–9. doi : 10.1093/dnares/1.5.223 . PMID 7584044 .
•    Stark LA, Hay RT (april 1998). "Humant immunbristvirus typ 1 (HIV-1) viralt protein R (Vpr) interagerar med Lys-tRNA-syntetas: implikationer för priming av HIV-1 omvänd transkription" . Journal of Virology . 72 (4): 3037–44. doi : 10.1128/JVI.72.4.3037-3044.1998 . PMC 109751 . PMID 9525626 .
•   Quevillon S, Robinson JC, Berthonneau E, Siatecka M, Mirande M (Jan 1999). "Makromolekylär sammansättning av aminoacyl-tRNA-syntetaser: identifiering av protein-protein-interaktioner och karakterisering av ett kärnprotein". Journal of Molecular Biology . 285 (1): 183–95. doi : 10.1006/jmbi.1998.2316 . PMID 9878398 .
•   Tolkunova E, Park H, Xia J, King MP, Davidson E (november 2000). "Den humana lysyl-tRNA-syntetasgenen kodar för både cytoplasmatiska och mitokondriella enzymer med hjälp av en ovanlig alternativ splitsning av det primära transkriptet. " Journal of Biological Chemistry . 275 (45): 35063–9. doi : 10.1074/jbc.M006265200 . PMID 10952987 .
•    Cen S, Khorchid A, Javanbakht H, Gabor J, Stello T, Shiba K, Musier-Forsyth K, Kleiman L (juni 2001). "Inkorporering av lysyl-tRNA-syntetas i humant immunbristvirus typ 1" . Journal of Virology . 75 (11): 5043–8. doi : 10.1128/JVI.75.11.5043-5048.2001 . PMC 114908 . PMID 11333884 .
•   Sang Lee J, Gyu Park S, Park H, Seol W, Lee S, Kim S (feb 2002). "Interaktionsnätverk av humana aminoacyl-tRNA-syntetaser och subenheter av förlängningsfaktor 1-komplex". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 291 (1): 158–64. doi : 10.1006/bbrc.2002.6398 . PMID 11829477 .
•    Ahn HC, Kim S, Lee BJ (maj 2003). "Lösningsstruktur och p43-bindning av p38-leucinblixtlåsmotivet: spiral-spiralinteraktioner förmedlar associationen mellan p38 och p43" . FEBS Bokstäver . 542 (1–3): 119–24. doi : 10.1016/S0014-5793(03)00362-4 . PMID 12729910 . S2CID 39222196 .
•   Javanbakht H, Halwani R, Cen S, Saadatmand J, Musier-Forsyth K, Gottlinger H, Kleiman L (Jul 2003). "Interaktionen mellan HIV-1 Gag och humant lysyl-tRNA-syntetas under viral montering" . Journal of Biological Chemistry . 278 (30): 27644–51. doi : 10.1074/jbc.M301840200 . PMID 12756246 .
•    Kim MJ, Park BJ, Kang YS, Kim HJ, Park JH, Kang JW, Lee SW, Han JM, Lee HW, Kim S (juli 2003). "Nedreglering av FUSE-bindande protein och c-myc av tRNA-syntetaskofaktor p38 krävs för differentiering av lungceller". Naturgenetik . 34 (3): 330–6. doi : 10.1038/ng1182 . PMID 12819782 . S2CID 41006480 .
•   Di Y, Li J, Zhang Y, He X, Lu H, Xu D, Ling J, Huo K, Wan D, Li YY, Gu J (juni 2003). "HCC-associerat protein HCAP1, en variant av GEMIN4, interagerar med zinkfingerproteiner". Journal of Biochemistry . 133 (6): 713–8. doi : 10.1093/jb/mvg091 . PMID 12869526 .