KAHA Ligation

α -Ketoacid-Hydroxylamin (KAHA) Amide-Forming Ligation är en kemisk reaktion som används för att sammanfoga två oskyddade fragment i peptidsyntes . Det är ett alternativ till Native Chemical Ligation (NCL) . KAHA Ligation utvecklades av Jeffrey W. Bode-gruppen vid ETH Zürich (tidigare University of Pennsylvania).

Översikt

En a-ketosyra vid C-terminalen av ett peptidfragment reagerar med en hydroxylamin vid N-terminalen av en annan för att bilda en peptidbindning (amidbindning).

Reaktionen kan ske i närvaro av oskyddade sidokedjor och den kräver inga kopplingsreagenser eller katalysatorer . De enda biprodukterna är vatten och CO ₂ .

Typ I KAHA Ligation (omodifierad hydroxigrupp)

Typ II KAHA Ligation (O-substituerad hydroxylamin)

Det första rapporterade proteinet syntetiserat genom KAHA-ligering var humant GLP-1 (7-36). Sedan dess har en mängd små proteiner (upp till 200 rester) syntetiserats, inklusive ubiquitin och andra liknande modifieringsproteiner, hormonproteiner, nitroforin 4, S100A4 och cykliska proteiner.

C-terminala ketosyramonomerer förladdas på harts via en länk för Fmoc-SPPS (Fmoc-baserad fastfaspeptidsyntes) . Initial forskning använde svavelylidlinkers, men på senare tid utvecklade gruppen syra- och fotolabila ketoacidmonomerer som kan laddas direkt på Rink Amide-harts.

Den mest använda N-terminala hydroxylaminen är 5-oxaprolin, vilket resulterar i en homoserinrest efter ligering och ON-omlagring.

^ Bode, Jeffrey W.; Fox, Ryan M.; Baucom, Kyle D. (2006). "Kemoselektiva amidligationer genom dekarboxylativa kondensationer av N-alkylhydroxylaminer och a-ketosyror". Angewandte Chemie . 118 (8): 1270–1274. doi : 10.1002/ange.200503991 . ISSN 0044-8249 .
^ Pusterla, Ivano; Bode, Jeffrey W. (2012). "Mekanismen för den a-ketosyra-hydroxilaminamidbildande ligeringen". Angewandte Chemie . 124 (2): 528–531. doi : 10.1002/ange.201107198 . ISSN 0044-8249 .

[BodeFox2006-1] Bode, Jeffrey W.; Fox, Ryan M.; Baucom, Kyle D. (2006). "Kemoselektiva amidligationer genom dekarboxylativa kondensationer av N-alkylhydroxylaminer och a-ketosyror". Angewandte Chemie . 118 (8): 1270–1274. doi : 10.1002/ange.200503991 . ISSN 0044-8249 .

[PusterlaBode2012-2] Pusterla, Ivano; Bode, Jeffrey W. (2012). "Mekanismen för den a-ketosyra-hydroxilaminamidbildande ligeringen". Angewandte Chemie . 124 (2): 528–531. doi : 10.1002/ange.201107198 . ISSN 0044-8249 .