Jordnötsagglutinin
Jordnötsagglutinin ( PNA ) är växtlektinprotein som härrör från frukterna av Arachis hypogaea . Jordnötsagglutinin kan också kallas Arachis hypogaea lectin . Lektiner känner igen och binder speciella sockersekvenser i kolhydrater; jordnötsagglutinin binder kolhydratsekvensen Gal -β(1-3) -GalNAc . Namnet "jordnötsagglutinin" kommer från dess förmåga att hålla ihop ( agglutinera ) celler, såsom neuraminidas -behandlade erytrocyter , som har glykoproteiner eller glykolipider på sin yta som inkluderar Gal-β(1-3)-GalNAc-kolhydratsekvensen.
Strukturera
| Baljväxtlektindomän | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktur av monosackaridbindningsstället för linslektin.
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| Symbol | Lectin_legB | ||||||||
| Pfam | PF00139 | ||||||||
| Pfam klan | CL0004 | ||||||||
| InterPro | IPR001220 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00278 | ||||||||
| SCOP2 | 1lem / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Proteinet är 273 aminosyror långt med de första 23 resterna som fungerar som en signalpeptid som sedan klyvs. Den har en Uniprot- access till P02872 . Det finns över 20 strukturer av detta protein i PDB som avslöjar och alla beta-arkproteiner med en tetramerisk kvartär struktur. Det är en medlem av Lectin_legB PFAM -familjen.
Tillgängliga strukturer av jordnötsagglutinin
Används inom cellbiologi och biokemi
Eftersom jordnötsagglutinin specifikt binder en viss kolhydratsekvens finner det användning i en rad metoder för cellbiologi och biokemi . Till exempel i PNA- affinitetskromatografi används bindningsspecificiteten för jordnötsagglutinin för att isolera glykosylerade molekyler som har sockersekvensen Gal-β(1-3)-GalNAc. Jordnötsagglutininaktivitet hämmas av laktos och galaktos som konkurrerar om bindningsstället.
Andra användningsområden inkluderar:
- Potent anti- T-cellsaktivitet .
- Att skilja mellan undergrupper av humana lymfocyter .
- Identifiering av koncells inre och yttre segment och i mindre utsträckning stavcells inre segment i däggdjursnäthinnan.
- Tumörvävnadsbestämning för övergångsmaligna slemhinnor .
- Identifiering av däggdjurssmittade metacykliska promastigot Leishmania major- parasiter från andra livscykelformer som också finns i sandflugsvärden .
- Identifiering av det yttre akrosommembranet i spermier, vilket indikerar akrosomintegritet.
Se även