John Marioni

John Marioni
Alma mater	Universitetet i Cambridge
Vetenskaplig karriär
Fält	Beräkningsbiologi Human Genetik encellig biologi
institutioner	University of Chicago University of Cambridge
Avhandling	Statistiska metoder för arrayCGH och kopienummervariationsexperiment ( 2007)
Doktorand rådgivare	Simon Tavaré

John Marioni är forskningschef vid European Bioinformatics Institute och har en anställning vid Wellcome Sanger Institute och Cancer Research UK Cambridge Institute vid Cambridge University . Han är en beräkningsbiolog känd för sin forskning om statistiska och beräkningsmetoder för analys av genomikdata, i synnerhet encellig biologi och evolutionär genomik. Han är medordförande för arbetsgruppen för Human Cell Atlas Analysis.

Forskning och karriär

Marioni har genomfört inflytelserika studier inom helvävnad och encellig transkriptomik . Han tog sin doktorsexamen från University of Cambridge i tillämpad matematik 2008. Han genomförde postdoktorala studier vid University of Chicago under Matthew Stephens .

Marioni är känd för att "bana banbrytande i den statistiska analysen av genuttrycksmönster i enskilda celler, vilket har lett till ett radikalt paradigmskifte inom området transkriptomik."

Utmärkelser och utmärkelser

• Blavatnik Awards Young Scientists 2021 finalist för Storbritanniens pris
• Vald stipendiat vid St Edmund's College, Cambridge (2016)
• John Wishart -priset för statistik, tilldelat av Statistical Laboratory vid University of Cambridge (2004)

Välj publikationer

• R Argelaguet, SJ Clark, H Mohammed, et al., JC Marioni, W Reik. Multi-omics profilering av mus gastrulation vid encellsupplösning. Naturen . doi:10.1038/s41586-019-1825-8
• L Haghverdi, ATL Lun, MD Morgan, JC Marioni. Batcheffekter i encelliga RNA-sekvenseringsdata korrigeras genom att matcha ömsesidiga närmaste grannar. Natur Bioteknik . doi:10.1038/nbt.4091
• B Pijuan-Sala, JA Griffiths, C Guibentif, et al., JC Marioni, B Göttgens. En encellig molekylär karta över möss gastrulation och tidig organogenes. Naturen . doi:10.1038/s41586-019-0933-9
• T Lohoff, S Ghazanfar, A Missarova, N Koulena, N Pierson, JA Griffiths, ES Bardot, CL Eng, RCV Tyser, R Argelaguet, C Guibentif, S Srinivas, J Briscoe, BD Simons, AK Hadjantonakis, B Göttgens, W Reik , J Nichols, L Cai, JC Marioni. Integration av rumsliga och encelliga transkriptomiska data belyser musorganogenes. Natur Bioteknik . doi:10.1038/s41587-021-01006-2
• R Argelaguet, ASE Cuomo, O Stegle, JC Marioni. Beräkningsprinciper och utmaningar i encellsdataintegration. Natur Bioteknik . doi:10.1038/s41587-021-00895-7 .

externa länkar

• John Marioni -publikationer indexerade av Google Scholar