IscR stabilitetselement
| iscR stabilitetselement | |
|---|---|
Sekundär struktur av iscR stabilitetselement RNA-
| |
| identifierare | |
| Symbol | iscRS |
| Rfam | RF01517 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Cis -reglerande element |
| Domän(er) | Enterobacteriales |
| PDB- strukturer | PDBe |
IscR -stabilitetselementet är en konserverad sekundär struktur som finns i de intergena regionerna av iscRSUA polycistroniskt mRNA . Denna sekundära struktur förhindrar nedbrytningen av iscR -mRNA:t .
IscRSUA- operonet kodar för de proteiner som krävs i järn-svavelklusterbiosyntes där uttrycket av detta operon regleras av RyhB och iscR, en transkriptionsrepressor. Under tillräckliga järnförhållanden binder RyhB till iscRSUA-mRNA och främjar nedbrytningen av mRNA som ligger nedströms iscR. Genom att skanna de intergena regionerna av detta polycistroniska mRNA och använda Mfold-mjukvara förutspåddes en sekundär struktur inom den intergena regionen mellan iscR och iscS och bekräftades senare genom blyacetat- sondering . Mutationer som stör denna sekundära struktur resulterade i nedbrytning av iscR-mRNA efter RyhB-bindning. 3′ RACE- analys av iscR-mRNA-fragmentet identifierade det intergena RNA:t vid 3′-änden. Dessa resultat tyder på att detta intergena RNA-element fungerar som ett iscR-mRNA-stabilitetselement genom att skydda iscR från exonukleasnedbrytning .
Vidare läsning
- Deng Z, Liu Z, Bi Y, Wang X, Zhou D, Yang R, Han Y (2014). "Snabb nedbrytning av Hfq-fritt RyhB i Yersinia pestis av PNPas oberoende av förmodade ribonukleolytiska komplex" . BioMed Research International . 2014 : 798918. doi : 10.1155/2014/798918 . PMC 4003864 . PMID 24818153 .