Irreligion i Nigeria mäts till mindre än en procent av befolkningen. Liksom i många delar av Afrika finns det en stor mängd stigma kopplat till att vara ateist .
En undersökning från 2010 av Pew Research Center visade att 51 % av nigerianska muslimer håller med om dödsstraffet för att lämna islam. I vissa delar av Nigeria finns det till och med lagar mot blasfemi.
2017 fick Humanist Association of Nigeria formellt erkännande från regeringen efter en 17-årig kamp. Detta följdes av erkännande av Atheist Society of Nigeria, Northern Nigerian Humanist Association och Nigerian Secular Society. Det anses mer artigt att använda termen "fri tänkare" när man hänvisar till en ateist. Exempel: Är du muslim, kristen eller 'fri tänkare'?