Intresseregion
En region av intresse (ofta förkortad ROI ) är ett urval inom en datamängd som identifierats för ett särskilt ändamål. Begreppet ROI används ofta inom många applikationsområden. Till exempel, vid medicinsk bildbehandling , kan gränserna för en tumör definieras på en bild eller i en volym, i syfte att mäta dess storlek. Den endokardiella gränsen kan definieras på en bild, kanske under olika faser av hjärtcykeln, till exempel ändsystol och änddiastol, i syfte att bedöma hjärtfunktionen. I geografiska informationssystem (GIS) kan en ROI tas bokstavligt som ett polygonalt urval från en 2D-karta. I datorseende och optisk teckenigenkänning definierar ROI gränserna för ett objekt som övervägs. I många applikationer läggs symboliska (textuella) etiketter till en ROI, för att beskriva dess innehåll på ett kompakt sätt. Inom en ROI kan det finnas individuella intressepunkter (POI).
Exempel på intressanta regioner
- 1D-datauppsättning: ett tids- eller frekvensintervall på en vågform
- 2D dataset: gränserna för ett objekt på en bild
- 3D-dataset: konturerna eller ytorna som beskriver ett objekt (ibland känt som volymen av intresse ( VOI )) i en volym
- 4D-datauppsättning: konturen av ett objekt vid eller under ett visst tidsintervall i en tidsvolym
En ROI är en form av anteckning , ofta förknippad med kategorisk eller kvantitativ information (t.ex. mätningar som volym eller medelintensitet), uttryckt som text eller i en strukturerad form.
Det finns tre fundamentalt olika sätt att koda en ROI:
- Som en integrerad del av exempeldatauppsättningen, med ett unikt eller maskeringsvärde som kanske ligger utanför det normala intervallet för normalt förekommande värden och som taggar enskilda dataceller
- Som separat, rent grafisk information, t.ex. med vektor- eller bitmappsritningselement (rastrerade), kanske med någon tillhörande vanlig ( ostrukturerad) text i själva dataformatet
- Som en separat strukturerad semantisk information (som kodade värdetyper ) med en uppsättning rumsliga och/eller tidsmässiga koordinater
Medicinsk avbildning
Medicinska bildbehandlingsstandarder som DICOM tillhandahåller allmänna och applikationsspecifika mekanismer för att stödja olika användningsfall.
För DICOM-bilder (två eller fler dimensioner):
- Bränd i grafik och text kan förekomma inom det normala pixelvärdesintervallet (t.ex. som det maximala vita värdet) (utfasad)
- Bitmap (rastrerad) överlagringsgrafik och text kan finnas i oanvända höga bitar av pixeldata eller i ett separat attribut (utfasad)
- Vektorgrafik kan kodas i separata bildattribut som kurvor (utfasad)
- Ostrukturerad vektorgrafik och text samt bitmapps (rastrerad) överlagringsgrafik kan kodas i ett separat objekt som ett presentationstillstånd som refererar till bildobjektet som det ska appliceras på
- Strukturerad data kan kodas i ett separat objekt som en strukturerad rapport i form av ett träd av namn-värde-par av kodade eller textbegrepp som eventuellt associeras med härledd kvantitativ information kan referera till rumsliga och/eller tidsmässiga koordinater som i sin tur refererar till bildobjekten som de gäller
- Referensplatser kan kodas som referenspunkter i form av rumsliga koordinater med ett tillhörande kodat syfte, antingen som pixelkoordinater genom referens till specifika bilder eller som koordinater i ett namngivet patientrelativt 3D kartesiskt utrymme
- Pixlar (eventuellt icke sammanhängande) kan klassificeras i segment kodade i ett segmenteringsobjekt som antingen binära eller probabilistiska värden i ett raster (som inte krävs för att ha samma rumsliga sampling eller omfattning som bilderna från vilka segmenteringen härleddes); dessa refereras vanligtvis av andra objekt som innehåller strukturerat innehåll (strukturerade rapporter)
För DICOM-strålbehandling:
- Objektkonturer kan definieras som strukturuppsättningar, antingen som pixelkoordinater med hänvisning till specifika bilder eller som koordinater i ett namngivet patientrelativt 3D kartesiskt utrymme (dessa används också för icke-RT-applikationer)
För DICOM tidsbaserade vågformer:
- Inbrända värden kan förekomma med vågformen (utfasad)
- Anteckningar kan kodas i ett separat attribut kan välja flera tidpunkter eller ett intervall av tidpunkter, antingen efter provnummer eller angiven tid
- Strukturerad data kan kodas i ett separat objekt som en strukturerad rapport i form av ett träd av namn-värdepar av kodade eller textbegrepp som eventuellt är associerade med härledd kvantitativ information kan referera till tidskoordinater som i sin tur refererar till de vågformsobjekt som de gäller
HL7 Clinical Document Architecture har också en undergrupp av mekanismer som liknar (och avsedda att vara kompatibla med) DICOM för att referera till bildrelaterade rumsliga koordinater som observationer; den tillåter att en cirkel, ellips, polylinje eller punkt definieras som heltals pixelrelativa koordinater som refererar till ett externt multimediabildobjekt, som kan vara av ett konsumentformat snarare än ett medicinskt bildformat (t.ex. en GIF , PNG eller JPEG ) .
Dokumentanalyssystem
I Optical Character Recognition (OCR) och Document Layout Analysis omfattar regioner av intresse (ROI) hierarkiskt sidor, text eller grafiska block, ner till individuella radbildsbilder, ord- och teckenbildrutor. De facto-standarden i arkiv och bibliotek är tupletten {image_file, xml_file}, vanligtvis i form av en *.tif-fil och dess medföljande *.xml-fil.
Andra 2D-applikationer
När det gäller icke-medicinska standarder, förutom de rent grafiska märkningsspråken (som PostScript eller PDF ) och vektorgrafik (som SVG ) och 3D (som VRML ) ritningsfilformat som är allmänt tillgängliga, och som har ingen specifik ROI-semantik, vissa standarder som JPEG 2000 tillhandahåller specifikt mekanismer för att märka och/eller komprimera till en annan grad av trohet, vad de refererar till som regioner av intresse.