International Neuroinformatics Coordinating Facility

International Neuroinformatics Coordinating Facility
Förkortning INCF
Bildning 2005 ; 18 år sedan ( 2005 )
Huvudkontor INCF sekretariat
Plats
Koordinater
Styrelseordförande
 Maryann Martone
Hemsida incf .org

International Neuroinformatics Coordinating Facility ( INCF ) är en internationell ideell organisation med uppdraget att utveckla, utvärdera och stödja standarder och bästa praxis som omfattar principerna för Open, FAIR och Citable neurovetenskap. INCF tillhandahåller också utbildning i hur standarder och bästa praxis underlättar reproducerbarhet och möjliggör publicering av hela forskningsresultatet, inklusive data och kod. INCF grundades 2005 genom rekommendationer från OECD: s arbetsgrupp för Global Science Forum . INCF är värd för Karolinska Institutet i Stockholm , Sverige . INCF-nätverket består av institutioner, organisationer, företag och individer som är verksamma inom neuroinformatik, neurovetenskap, datavetenskap, teknik och vetenskapspolitik och publicering. Nätverket är organiserat i styrande organ och arbetsgrupper som samordnar olika kategorier av globala neuroinformatiska aktiviteter som vägleder och övervakar utvecklingen och godkännandet av standarder och bästa praxis, samt tillhandahåller utbildning om hur standarder och bästa praxis underlättar reproducerbarhet och möjliggör publicering av hela forskningsresultatet, inklusive data och kod. De nuvarande styrelseledamöterna är Mathew Abrams och Helena Ledmyr, och styrelsens ordförande är Maryann Martone

INCF-nätverket syftar till att främja tillämpningen av beräkningsmetoder för att förstå hjärnan och att utveckla den infrastruktur som krävs för att använda beräkningsmetoder för att integrera och analysera olika data över skalor, tekniker och arter för att förstå hjärnan och positivt påverka hälsan och välmåendet. vara av samhället.

Bakgrund

Se även: Neuroinformatik

En nyckelfaktor för att framgångsrikt förstå nervsystemet är integrationen av neurovetenskap med informationsvetenskap . Fältet som studerar nervsystemet, neurovetenskap, har svarat på den fantastiska utmaningen att förstå hur vår hjärna fungerar med användning av de mest sofistikerade teknologierna, från studier av genomet till studier om hjärnavbildning av beteende hos människor och andra arter , under olika funktionstillstånd, och på alla mellanliggande analytiska nivåer. Denna ansträngning har resulterat i stora mängder data, som ständigt ökar med högre komplexitetsnivåer. Data som produceras är heterogena och kommer från olika nivåer av studier och analysmetoder. För att ta sig an denna utmaning med integration, och för att säkerställa effektiv och maximal användning av dessa data, är det nu nödvändigt att utveckla och skapa dessa delade resurser:

  1. neurovetenskapliga data- och kunskapsdatabaser;
  2. analytiska och modelleringsverktyg; och
  3. beräkningsmodeller.

Denna utmaning möts genom sammanslagning av neurovetenskap med informationsvetenskap – området neuroinformatik.

Historia

Genesis

Rekommendationen att samordna internationella insatser inom det nya området neuroinformatik gjordes först i rapporten om bioinformatik som utarbetades under ledning av dåvarande OECD Megascience Forum 1998. Efter omfattande diskussioner i Neuroinformatics Working Group of the Global Science Forum ledd av Dr. Stephen H. Koslow, förslaget att skapa ett internationellt samordningsråd för neuroinformatik och ett system för bidragsfinansiering för neuroinformatikforskning presenterades sedan 2002. Detta projekt godkändes av OECD:s vetenskapsministrar vid deras möte i januari 2004. Sexton länder (Australien, Kanada) , Kina, Tjeckien, Danmark, Finland, Frankrike, Tyskland, Indien, Italien, Japan, Nederländerna, Norge, Sverige, Schweiz, Storbritannien, USA och Victoria, Australien), samt Europeiska kommissionen, utarbetade sedan de arbetsdokument som utgör den rättsliga grunden för INCF och programmet för internationell neuroinformatik (PIN).

Etablering

Villkoren för inrättandet av INCF uppfylldes i juli 2005, då sju länder (Tjeckien, Finland, Tyskland, Norge, Sverige, Schweiz och USA) hade undertecknat samförståndsdokumentet och utfäst sitt ekonomiska bidrag. Ett anbud om att vara värd för INCF-sekretariatet lanserades. Två förslag inkom och, enligt styrelsens instruktioner, sammankallade OECD den 3 november en expertpanel för att granska och rangordna förslagen. Panelen tilldelade det svenska förslaget den högre rankingen, och denna rekommendation godkändes av INCF:s styrelse när den sammanträdde i OECD:s högkvarter den 28 november. Efter omfattande internationella diskussioner invigdes INCF officiellt i februari 2007, med huvudkontor på Karolinska Institutet i Stockholm.

INCF främjar samarbete inom neuroinformatik och reproducerbarhet i hjärnforskning av

  • tillhandahålla samordning av global neurovetenskaplig infrastruktur genom utveckling och godkännande av standarder och bästa praxis till stöd för öppen och FAIR (Findable Accessible Interoperable Reusable) neurovetenskap ( FAIR-data )
  • utbilda forskare, administratörer och studenter i hur neuroinformatik främjar rigoritet och reproducerbarhet, öppen och FAIR vetenskap och publicerar hela sin forskningsresultat: berättelse, data och kod
  • uppmuntra neurovetenskap som disciplin att gå mot FORCE (FAIR, Open, Research-objektbaserat och Citable Ecosystem)
  • främja framsteg och fortsatt utveckling av neuroinformatik som en vetenskaplig disciplin

Nyckelprogramleveranser

omfatta

  • Waxholm Space (WHS), ett koordinatbaserat referensutrymme för gnagarhjärnan
  • Scalable Brain Atlas, en webbaserad visningsmotor för hjärnatlaser, bilddata och topologier
  • NineML, ett allmänt modellbeskrivningsspråk
  • Multi-Simulation Coordinator (MUSIC), som tillåter storskaliga neuronsimulatorer och andra applikationer att kommunicera under körning
  • Neuroimaging Informatics Data Model (NI-DM), ett ramverk för generering, lagring och sökning av metadata inklusive härkomstinformation
  • KnowledgeSpace, ett samhällsbaserat uppslagsverk som kopplar samman hjärnforskningskoncept med data, modeller och litteratur från hela världen
  • TrainingSpace, ett onlineförråd som länkar samman neuroinformatikutbildningsresurser som utvecklats både av INCF, våra partners och befintliga communityresurser.

Se även

externa länkar

Hämtad från " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=International_Neuroinformatics_Coordinating_Facility&oldid=1035288035 "