IQ calmodulin-bindande motiv
| IQ calmodulin-bindande motiv | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktur av den regulatoriska domänen av pilgrimsmussla myosin vid 2 A upplösning.
| |||||||||||
| Identifierare | |||||||||||
| Symbol | IQ | ||||||||||
| Pfam | PF00612 | ||||||||||
| InterPro | IPR000048 | ||||||||||
| SMART | SM00015 | ||||||||||
| PROSITE | PS50096 | ||||||||||
| SCOP2 | 1wdc / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
| |||||||||||
Det IQ-kalmodulinbindande motivet är ett aminosyrasekvensmotiv som innehåller följande sekvens :
- [FILV]Qxxx[RK]Gxxx[RK]xx[FILVWY]
Termen "IQ" hänvisar till de två första aminosyrorna i motivet: isoleucin (vanligtvis) och glutamin (alltid).
Fungera
Calmodulin (CaM) är erkänt som en viktig kalcium (Ca2 + ) sensor och orkestrator av regulatoriska händelser genom dess interaktion med en mångfaldig grupp av cellulära proteiner. Tre klasser av igenkänningsmotiv existerar för många av de kända CaM-bindande proteinerna; IQ-motivet som en konsensus för Ca2 + -oberoende bindning och två relaterade motiv för Ca2 + -beroende bindning, benämnda 1-14 och 1-5-10 baserat på positionen för konserverade hydrofoba rester.
Exempel
Den regulatoriska domänen för kammusslor myosin är ett trekedjigt proteinkomplex som slår på denna motor som svar på Ca 2+ bindning. Sidokedjeinteraktioner länkar de två lätta kedjorna i tandem till intilliggande segment av den tunga kedjan som bär IQ-sekvensmotivet. Ca 2+ -bindningsstället är ett nytt EF-handmotiv på den essentiella lätta kedjan och stabiliseras av länkar som involverar den tunga kedjan och båda lätta kedjorna, vilket står för kravet på alla tre kedjorna för Ca 2+ -bindning och reglering i intakt myosinmolekyl.