IMGT
| Innehåll | |
|---|---|
| Beskrivning | Nukleinsekvenser, aminosyror, kommentarer och verktyg relaterade till det adaptiva immunsystemet. |
| Organismer | Ryggradsdjur |
| Utgivningsdatum | 1989 |
| Tillgång | |
| Hemsida | IMGT |
IMGT eller det internationella informationssystemet ImMunoGeneTics är en samling databaser och resurser för immuninformatik , särskilt V-, D-, J- och C- gensekvenserna, samt tillhandahåller andra verktyg och data relaterade till det adaptiva immunsystemet . IMGT/LIGM-DB, den första och fortfarande största databasen som är värd som en del av IMGT innehåller referensnukleotidsekvenser för 360 arters T-cellsreceptor- och immunglobulinmolekyler , från och med 2023. Dessa gener kodar för de proteiner som är grunden för adaptiv immunitet, vilket möjliggör mycket specifik igenkänning och minne av patogener.
Historia
IMGT grundades i juni 1989 av Marie-Paule Lefranc, en immunolog som arbetar vid University of Montpellier . Projektet presenterades för den 10:e Human Genome Mapping Workshop och resulterade i erkännandet av V-, D-, J- och C-regioner som gener. Den första resursen som skapades var IMGT/LIGM-DB, en referens för nukleotidsekvenser av T-cellsreceptorer och immunglobulin hos människor och senare ryggradsdjursarter. IMGT skapades under överinseende av Laboratoire d'ImmunoGénétique Moléculaire vid universitetet i Montpellier samt franska nationella centret för vetenskaplig forskning ( CNRS).
Eftersom både T-cellsreceptorer och immunglobulinmolekyler byggs upp genom en process av rekombination av nukleotidsekvenser, är annoteringen av regionerna i byggstensregionerna och deras roll unik inom genomet. För att standardisera terminologi och referenser skapades IMGT-NC 1992 och erkändes av International Union of Immunological Societies som en nomenklaturunderkommitté. Andra verktyg inkluderar IMGT/Collier-de-Perles, en metod för tvådimensionell representation av receptoraminosyrasekvenser, och IMGT/mAb-DB, en databas med monoklonala antikroppar . Nu upprätthålls av HLA Informatics Group , den primära referensen för human HLA, IPD-IMGT/HLA Database, härstammar delvis från IMGT. Den slogs samman med Immuno Polymorphism Database 2003 för att bilda den nuvarande referensen.
Sedan 2015 leds IMGT av Sofia Kossida.