Haloarcula hispanica SH1-virus
Haloarcula hispanica virus SH1 | |
---|---|
Virusklassificering | |
(orankad): | Virus |
Rike : | Varidnaviria |
Rike: | Helvetiavirae |
Provins: | Dividoviricota |
Klass: | Laserviricetes |
Beställa: | Halopanivirales |
Familj: | Sphaerolipoviridae |
Släkte: | Alphasphaerolipovirus |
Arter: |
Haloarcula hispanica virus SH1
|
Haloarcula hispanica SH1-virus är ett dubbelsträngat DNA-virus som infekterar arkeonen Haloarcula hispanica . Detta virus har ett antal unika egenskaper som var olik alla andra kända virus när det beskrevs. Men likheter har sedan dess hittats med Thermus thermophilus-viruset P23-77 och Thermus aquaticus-viruset IN93. Dessa virus kan bilda ett nytt taxon vid nästa revidering av taxonomin av ICTV .
Virologi
Vironerna är icosaedriska till formen med ett trianguleringstal på 28. Kapsomererna är dekorerade med en tornliknande struktur och innehåller ett inre lipidmembran som ligger under proteinkapsiden. Lipidmembranet innehåller fosfatidylglycerol , fosfatidylglycerofosfatmetylester och fosfatidylglycerosulfat. Basen av kapsomeren tycks bildas av ett hexameriskt enkel beta-fat-protein. [ citat behövs ]
Det finns 15 strukturella proteiner i kapsiden som varierar i molekylvikt mellan 185 kilo Dalton (kDa) och 4 kDa. Dessa har numrerats från VP1 till VP 15. Sju verkar vara mindre komponenter (VP5, VP6, VP8, VP11, VP13, VP14 och VP15). [ citat behövs ]
VP12 (molekylvikt 9,8 kDa) har två membranomspännande helixar vilket tyder på att det är ett integrerat membranprotein. [ citat behövs ]
VP2 kan vara ett långsträckt fiberliknande protein som är lämpligt för att bilda en spik. [ citat behövs ]
Genom
Genomet är linjärt 30 898 baspar i längd och innehåller 309 baspar inverterade terminala upprepade sekvenser. G +C- halten är 68,4%. Den kodar 56 öppna läsramar (ORF). [ citat behövs ]
De strukturella proteinerna motsvarar ORF enligt följande: [ citat behövs ]
- ORF13 – VP1
- ORF23 – VP12
- ORF24 – VP7
- ORF25 – VP4
- ORF27 – VP13
- ORF28 – VP2
- ORF29 – VP5
- ORF30 – VP10
- ORF31 – VP9
- ORF32 – VP3
- ORF33 – VP6
Alla strukturella proteiner är belägna i mitten av genomet.
ORF 17 kodar för ett protein med ATPas-domän.