Haloarcula hispanica SH1-virus

Haloarcula hispanica virus SH1
Virusklassificering
(orankad): Virus
Rike : Varidnaviria
Rike: Helvetiavirae
Provins: Dividoviricota
Klass: Laserviricetes
Beställa: Halopanivirales
Familj: Sphaerolipoviridae
Släkte: Alphasphaerolipovirus
Arter:
Haloarcula hispanica virus SH1

Haloarcula hispanica SH1-virus är ett dubbelsträngat DNA-virus som infekterar arkeonen Haloarcula hispanica . Detta virus har ett antal unika egenskaper som var olik alla andra kända virus när det beskrevs. Men likheter har sedan dess hittats med Thermus thermophilus-viruset P23-77 och Thermus aquaticus-viruset IN93. Dessa virus kan bilda ett nytt taxon vid nästa revidering av taxonomin av ICTV .

Virologi

Vironerna är icosaedriska till formen med ett trianguleringstal på 28. Kapsomererna är dekorerade med en tornliknande struktur och innehåller ett inre lipidmembran som ligger under proteinkapsiden. Lipidmembranet innehåller fosfatidylglycerol , fosfatidylglycerofosfatmetylester och fosfatidylglycerosulfat. Basen av kapsomeren tycks bildas av ett hexameriskt enkel beta-fat-protein. [ citat behövs ]

Det finns 15 strukturella proteiner i kapsiden som varierar i molekylvikt mellan 185 kilo Dalton (kDa) och 4 kDa. Dessa har numrerats från VP1 till VP 15. Sju verkar vara mindre komponenter (VP5, VP6, VP8, VP11, VP13, VP14 och VP15). [ citat behövs ]

VP12 (molekylvikt 9,8 kDa) har två membranomspännande helixar vilket tyder på att det är ett integrerat membranprotein. [ citat behövs ]

VP2 kan vara ett långsträckt fiberliknande protein som är lämpligt för att bilda en spik. [ citat behövs ]

Genom

Genomet är linjärt 30 898 baspar i längd och innehåller 309 baspar inverterade terminala upprepade sekvenser. G +C- halten är 68,4%. Den kodar 56 öppna läsramar (ORF). [ citat behövs ]

De strukturella proteinerna motsvarar ORF enligt följande: [ citat behövs ]

  • ORF13 – VP1
  • ORF23 – VP12
  • ORF24 – VP7
  • ORF25 – VP4
  • ORF27 – VP13
  • ORF28 – VP2
  • ORF29 – VP5
  • ORF30 – VP10
  • ORF31 – VP9
  • ORF32 – VP3
  • ORF33 – VP6

Alla strukturella proteiner är belägna i mitten av genomet.

ORF 17 kodar för ett protein med ATPas-domän.