HAMP-domän

HAMP-
identifierare
Symbol HAMPA
Pfam PF00672
InterPro IPR003660
SCOP2 2asx / SCOPe / SUPFAM
OPM-protein 5iji
CDD cd06225
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Inom molekylärbiologi är HAMP -domänen (närvarande i histidinkinaser , adenylatcyklaser , metylaccepterande proteiner och fosfataser ) en alfa-spiralformad region med ungefär 50 aminosyror som bildar en dimer, fyrspiralformad spiral . Det finns i bakteriella sensor- och kemotaxiproteiner och i eukaryota histidinkinaser. Bakterieproteinerna är vanligtvis integrerade membranproteiner och en del av en tvåkomponents signaltransduktionsväg . En eller flera kopior av HAMP-domänen kan hittas i samband med andra domäner, såsom histidinkinasdomänen, den bakteriella kemotaxis sensoriska transducerdomänen, PAS-repeten, EAL-domänen, GGDEF- domänen , den proteinfosfatas 2C - liknande domänen guanylatcyklasdomänen , eller den responsregulatoriska domänen . I sin vanligaste miljö överför HAMP-domänen konformationsförändringar i periplasmatiska ligandbindande domäner till cytoplasmatiska signalkinas- och metylacceptordomäner och reglerar således fosforylerings- eller metyleringsaktiviteten hos homodimera receptorer .

Den här artikeln innehåller text från det offentliga området Pfam och InterPro : IPR003660