GlmZ RNA
| GlmZ RNA-aktivator av glmS mRNA | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av GlmZ_SraJ-
| |
| identifierare | |
| Symbol | GlmZ_SraJ |
| Alt. Symboler | SraJ |
| Rfam | RF00083 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; sRNA |
| Domän(er) | Bakterie |
| SÅ | SO:0000655 |
| PDB- strukturer | PDBe |
GlmZ (formellt känt som SraJ ) är ett litet icke-kodande RNA (ncRNA). Det är den funktionella produkten av en gen som inte översätts till protein .
Detta ncRNA upptäcktes i bakterien Escherichia coli under en storskalig beräkningsscreening för transkriptionssignaler och genomiska egenskaper hos kända små RNA-kodande gener. Under denna screening identifierades 14 nya ncRNA-gener, inklusive SraB , SraC , SraD och SraG .
Uttrycket av SraJ bekräftades experimentellt med Northern blotting . Detta ncRNA uttrycks i tidig logaritmisk fas , men dess nivå minskar till stationär fas. Northern blot-analys indikerade också att detta RNA genomgår specifik klyvningsbearbetning.
GlmZ sRNA har visat sig positivt kontrollera syntesen av GlmS mRNA . GlmZ regleras av ett relaterat sRNA som kallas GlmY . GlmY fungerar som en anti-adaptor, den binder till RapZ (RNase-adapterprotein för sRNA GlmZ), denna bindning förhindrar RapZ från att binda till GlmZ och riktar in den för klyvning av RNase E.