Fumaratlyas
Lyasidentifierare | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
_ | |||||||||||
Symbol | Lyase_1 | ||||||||||
Pfam | PF00206 | ||||||||||
InterPro | IPR000362 | ||||||||||
PROSITE | PDOC00147 | ||||||||||
SCOP2 | 1jsw / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
CDD | cd01362 | ||||||||||
|
Fumaratlyas är ett substrat av lyasklassen av enzymer.
Det har visat sig dela en kort konserverad sekvens kring en metionin som troligen är involverad i den katalytiska aktiviteten hos denna typ av enzymer. Följande är exempel på medlemmar i denna familj:
- 3-karboximukonat laktoniserande enzym, EC 5.5.1.2 (3-karboxi-cis, cis-mukonat cykloisomeras), ett enzym involverat i katabolism av aromatiska syror.
- Delta-kristallin delar cirka 90% sekvensidentitet med arginosuccinatlyas, vilket visar att det är ett exempel på ett "kapat" enzym - ackumulerade mutationer har dock gjort proteinet enzymatiskt inaktivt.
- Klass I fumarasenzym , EC 4.2.1.2 ( fumarathydratas ), som katalyserar den reversibla hydreringen av fumarat till L-malat. Klass I-enzymer är termolabila dimera enzymer (som till exempel: Escherichia coli fumA och fumB).
- Arginosuccinas, EC 4.3.2.1 ( argininosuccinatlyas ), som katalyserar bildningen av arginin och fumarat från argininosuccinat, det sista steget i biosyntesen av arginin.
- Aspartatammoniaklyas, EC 4.3.1.1 ( aspartas ), som katalyserar den reversibla omvandlingen av aspartat till fumarat och ammoniak. Denna reaktion är analog med den som katalyseras av fumaras, förutom att ammoniak snarare än vatten är involverad i transelimineringsreaktionen.
- klass II fumarasenzym, EC 4.2.1.2 , är termostabila och tetramera och finns i prokaryoter (som till exempel: Escherichia coli fumC) såväl som i eukaryoter. Sekvensen för de två klasserna av fumaraser är inte nära besläktade.
- Adenylosuccinas, EC 4.3.2.2 ( adenylosuccinatlyas ), som katalyserar det åttonde steget i de novo biosyntesen av puriner, bildningen av 5'-fosforibosyl-5-amino-4-imidazolkarboxamid och fumarat från 1-(5-yl)fosforibosyl. 4-(N-succino-karboxamid). Det enzymet kan också katalysera bildningen av fumarat och AMP från adenylosuccinat .
Kategorier: