Fimbrial usher protein
| Fimbrial Usher protein | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktur av typ 1 pilus monteringsplattform FimD(25-139).
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| Symbol | Vaktmästare | ||||||||
| Pfam | PF00577 | ||||||||
| InterPro | IPR000015 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00886 | ||||||||
| TCDB | 1.B.11 | ||||||||
| OPM superfamilj | 187 | ||||||||
| OPM-protein | 4j3o | ||||||||
| |||||||||
Det fimbriala usherproteinet är involverat i biogenes av pilus i gramnegativa bakterier . Biogenes av vissa fimbriae (eller pili) kräver ett tvåkomponentssammansättnings- och transportsystem som är sammansatt av en periplasmatisk chaperon och ett porbildande yttre membranprotein som har kallats en molekylär "vaktmästare"; detta är chaperone-usher-vägen .
Usherproteinet har en molekylvikt som sträcker sig från 86 till 100 kDa och är sammansatt av en membranomspännande 24-strängad beta-fatdomän, som påminner om poriner , och av fyra periplasmatiska lösliga domäner: en N-terminal med cirka 120 rester (NTD) ), en 'mitt' domän med cirka 80 rester belägen som en löslig infogning inom beta-cylinderregionen av sekvensen (pluggdomän) och två IG-liknande domäner (var och en cirka 80 rester långa) vid C-terminalen (CTD1 och CTD2 ). Även om graden av sekvenslikhet för dessa proteiner inte är särskilt hög delar de ett antal egenskaper. En av dessa är närvaron av två par disulfidbindningsbildande cysteiner, den första i NTD och den andra i CTD2. Den bäst bevarade regionen av sekvensen motsvarar pluggdomänen.