Epilepsifenom/genomprojekt
Epilepsifenomen/genomprojektet ( EPGP ) är en statligt finansierad studie för att identifiera gener som påverkar utvecklingen av epilepsi och gener som påverkar svaret på behandling. Studien involverar 25 stora epilepsicenter och mer än 150 forskare och klinisk personal runt om i USA, Australien och Argentina. Målet är att skapa ett arkiv av klinisk och genetisk information om en utvald grupp patienter med epilepsi. Förhoppningen är att denna information ska avslöja nya insikter och förbättra diagnostik och behandling.
EPGP finansieras av National Institutes of Health via National Institute for Neurological Disorders and Stroke (NINDS) .
Det långsiktiga målet med EPGP är att identifiera potentiella molekylära mål som kan ligga till grund för mycket mer specifika och effektiva behandlingar för patienter som har epilepsi, och förebyggande av epilepsi hos personer i riskzonen.
Bakgrund om gener och epilepsi
Även om ärftlighet sedan antiken har varit känt för att orsaka epilepsi, har framstegen hittills när det gäller att identifiera den genetiska grunden för epilepsi begränsats främst till upptäckten av enskilda genmutationer som orsakar epilepsi i relativt sällsynta familjer. För de vanligare typerna av epilepsi spelar ärftlighet en mer subtil roll, och man tror att en kombination av mutationer i flera gener sannolikt bestämmer en individs känslighet för anfall, såväl som känsligheten för antiepileptika. [ citat behövs ]
Fenotypning
Tillvägagångssättet för att reta isär de mer komplicerade genetiska faktorerna vid epilepsi kräver ett mycket stort antal patienter vars epilepsi har karakteriserats mycket väl. EPGP-utredare kommer att registrera 3 750 patienter och 3 000 kontroller under studiens gång. [ citat behövs ]
Detaljer om anfallstyper, EEG, avbildningsstudier och effekter av behandling kommer att samlas in och arkiveras i ett centralt datalager, och alla deltagare kommer att uppmanas att lämna in ett blodprov som en källa till sitt DNA. När denna första fas av studien är klar kommer genomiska analyser att användas för att identifiera potentiella samband mellan mönster av DNA-sekvenser och specifika egenskaper hos epilepsi i studiepopulationen. [ citat behövs ]
Genotypning
Syfte 1: Identifiera genetiska varianter av vanliga former av epilepsi
Vi antar att en betydande del av den ärftliga risken för epilepsi och farmakorresistens beror på ett litet till måttligt antal vanliga frekvenser (frekvens > 1%) allelvarianter med blygsamma till måttliga relativa risker.
Delmål 1.1 kommer att identifiera loci som bidrar till förekomsten och typen av epilepsi.
Delmål 1.2 kommer att identifiera loci som är associerade med farmakosvar på AED.
Syfte 2: Fastställa genetisk påverkan vid sällsynt, svår epilepsi
Vi kommer att bestämma rollen för de novo kopienummerpolymorfismer (CNP) i IS, LGS och PMG/PVNH. Vi kommer att utvärdera rollen för ärvda CNP:er i IS, LGS och PMG/PVNH.
Se även
- Winawer, MR, Fenotypdefinition vid epilepsi. Epilepsibeteende, 2006.
- Andermann, F., E. Kobayashi och E. Andermann, Genetic focal epilepsis: state of the art and paths to the future. Epilepsi, 2005. 46 Suppl 10: sid. 61-7.
- Gardiner, M., Genetics of idiopathic generalized epilepsis. Epilepsi, 2005. 46 Suppl 9: sid. 15-20.
- Crino, PB, H. Miyata och HV Vinters, Neuroutvecklingsstörningar som orsak till anfall: neuropatologiska, genetiska och mekanistiska överväganden. Brain Pathol, 2002. 12(2): sid. 212-33.
- Szoeke, CE, et al., Uppdatering om farmakogenetik vid epilepsi: en kort recension. Lancet Neurol, 2006. 5(2): sid. 189-96.
- Choi H, Winawer MR, Kalachikov S, Pedley TA, Hauser WA, Ottman R. Klassificering av partiella anfallssymptom i genetiska studier av epilepsierna. Neurologi. 2006 juni 13;66(11):1648-53.
- Freimer N, Sabatti C. Det mänskliga fenomenets projekt. Nat Genet. 2003 maj;34(1):15-21