Cyanophag N-1
| Cyanofag N-1 | |
|---|---|
| Virusklassificering | |
| Grupp: |
Grupp I ( dsDNA )
|
| Beställa: | |
| Familj: | |
| Släkte: |
Cyanomyovirus (föreslagna)
|
| Arter: |
Cyanophag N-1
|
Cyanofag N-1 är en myovirusbakteriofag som infekterar filamentösa sötvattenscyanobakterier av släktet Nostoc . Viruset isolerades först av Kenneth Adolph och Robert Haselkorn 1971 i USA, från den kvävefixerande cyanobakterien, Nostoc muscorum . N-1 är nära besläktad med cyanofager A-1, men endast på avstånd till andra cyanofager av sötvattens- eller marint ursprung.
Strukturera
Viruset har ett polyedriskt huvud med en diameter på cirka 61 nm. Den kontraktila svansen är 100 nm lång och är fäst vid huvudet via en svanshuvud. Halsregionen bär fibrer. Den mogna viruspartikeln innehåller minst 19 proteiner.
Genom
Det linjära, dubbelsträngade DNA- genomet är 64 960 baspar i längd - bara hälften så stor som de flesta fager med kontraktila svansar, som vanligtvis ligger i intervallet 161–231 kb. Den har ett GC-innehåll på 35,4 %. Av de 91 öppna läsramarna (ORF) visar endast 33 likheter med andra kända sekvenser. Anmärkningsvärt nog kodar genomet av Cyanophage N1 för en funktionell CRISPR- array, som har föreslagits för att skydda värden mot infektion av konkurrerande virus.
Livscykel och interaktion med värden
Det optimala pH-värdet för viral adsorption till N. muscorum är 7,6–8,1. Adsorptionshastigheten minskar med stigande ålder hos värdcellerna. Den virala latenta perioden är 7 timmar, vilket liknar cyanofager i LPP-1-gruppen. Burststorleken är 100 plackbildande enheter per cell.
Värdfotosyntes krävs för att viruset ska replikera, med fotosyntes som krävs under hela livscykeln, snarare än vid någon speciell punkt . Viral replikation drivs av cyklisk fotofosforylering och användning av kolhydratförråd ; fotosystem II- aktivitet krävs inte. Cyanofag N-1-infektion av N. muscorum är associerad med flera förändringar i värdens kol- och kvävemetabolism, inklusive en ökning av koncentrationen av glukos-6-fosfatdehydrogenasenzym och en minskning av glutaminsyntetasaktivitet .
Källor
- Kalender R. The Bacteriophages ( Oxford University Press ; 2006) ( ISBN 0195148509 )
- Sarma TA. Handbook of Cyanobacteria ( CRC Press ; 2012) ( ISBN 1466559411 )