Cistrome

Med enkla ord hänvisar cistromen till en samling reglerande element i en uppsättning gener, inklusive transkriptionsfaktorbindningsställen och histonmodifieringar. Mer specifikt, "uppsättningen av cis-verkande mål för en transverkande faktor i en genomomfattande skala, även känd som den in vivo genomomfattande platsen för transkriptionsfaktorbindningsställen eller histonmodifieringar ". Termen cistrom är en portmanteau av cistr (från cistron ) + ome (från genom ). Termen cistrome myntades av utredare vid Dana-Farber Cancer Institute och Harvard Medical School .

Teknologier som kromatinimmunutfällning kombinerat med mikroarrayanalys " ChIP-on-chip " eller med massivt parallell DNA-sekvensering " ChIP-Seq " har avsevärt underlättat definitionen av cistromen av transkriptionsfaktorer och andra kromatinassocierade proteiner.

Vidare läsning

•    Lupien M, Eeckhoute J, Meyer CA, Wang Q, Zhang Y, Li W, Carroll JS, Liu XS, Brown M (mars 2008). "FoxA1 översätter epigenetiska signaturer till förstärkardriven härstamningsspecifik transkription" . Cell . 132 (6): 958–70. doi : 10.1016/j.cell.2008.01.018 . PMC 2323438 . PMID 18358809 .
•   Lupien M, Brown M (juni 2009). "Cistromics av ​​hormonberoende cancer" . Endocr. Relat. Cancer . 16 (2): 381–9. doi : 10.1677/ERC-09-0038 . PMID 19369485 .