Chrysochromulina ericina virus
|
|
| Chrysochromulina ericina virus 01B | |
|---|---|
| Tunna sektioner av en cell från Haptolina ericina infekterad med CeV-01B | |
| virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Varidnaviria |
| Rike: | Bamfordvirae |
| Provins: | Nucleocytoviricota |
| Klass: | Megaviricetes |
| Beställa: | Imitervirales |
| Familj: | Mimiviridae (?) |
| Virus: |
Chrysochromulina ericina virus 01B
|
Chrysochromulina ericina virus 01B , eller helt enkelt Chrysochromulina ericina virus ( CeV ) är ett jättevirus i familjen Mimiviridae som infekterar Haptolina ericina (tidigare tillskrivet släktet Chrysochromulina ), en marin mikroalgmedlem av Haptophyta . CeV är ett dsDNA-virus .
Historia och taxonomi
CeV upptäcktes i de norska kustvattnen 1998. Den isolerades sedan och karakteriserades. Det antogs då tillhöra phycodnaviridae tillsammans med alla andra kända alger som infekterar virus. Upptäckten av Acanthamoeba polyphaga mimivirus hjälpte till att upptäcka att det fanns marina mimivirus som kunde infektera mikroalger. En CeV-stam hittades senare i Gulf of Main 2013 och den fylogenetiska analysen av någon specifik markör bekräftade dess närhet till mimivirus . Under 2015 sekvenserades CeV helt för att klassificera den som en mimiviridae
Det föreslogs nyligen en grupp mimiviridae som infekterar mikroalger som skulle inkludera CeV tillsammans med Phaeocystis globosa-virus (PgV) som infekterar en haptophyceae och Aureococcus anophagefferens-virus (AaV) som infekterar en stramenopil .
Strukturera
CeV har en diameter på 160 nm. Den har en ikosaedrisk struktur och inget yttre membran.
Genom
CeV:s genom har 473 558 bp och en låg GC-halt på 25 %. Det förutspås ha 512 ORFs . CeV har ett stort antal kärngener som huvudkapsidproteinet och DNA-polymeras B nära respektive gener för PgV. CeV kan ha förmågan att reparera sitt DNA som det föreslås av närvaron av sekvenserna av MutS7 och ett DNA-reparationsnukleas av ERCC4-typ (som är involverat i DNA-reparation). Detta sista enzym används vanligtvis för att reparera DNA-skador orsakade av UV-ljus, vilket är förenligt med livsmiljön för en mimiviridae som infekterar en fotosyntetisk värd. Den har också 305 unika gener som inte hittade någon match i de offentliga databaserna
Viral cykel
Lite är känt om CeV:s cykel. Det replikerar i värdens cytoplasma och dess lytiska cykel varar 14 till 19 timmar. CeV har i sitt genom en sekvens som kodar för ett DNA-polymeras och två RNA-polymeras II DNA-beroende. Den har också tolv tRNA som indikerar ett viktigt maskineri som möjliggör en relativt oberoende replikation och virionbildning som är karakteristisk för mimiviridea.