Centrum för genomisk reglering
 | |
| Etablerade | 2000 |
|---|---|
| Direktör | Luis Serrano |
| Personal | ~400 [ citat behövs ] |
| Plats | , |
| Hemsida | http://www.crg.eu |
Centre for Genomic Regulation (CRG, Centre de Regulació Genòmica på katalanska ) är ett biomedicinskt och genomiskt forskningscenter baserat på Barcelona . De flesta av dess anläggningar och laboratorier ligger i Barcelona Biomedical Research Park , framför Somorrostro-stranden .
Sedan juli 2015 blev CNAG (National Centre for Genomic Analysis), som ligger i Parc Científic de Barcelona (nära Camp Nou ), en utstationering för CRG. CRG är medlem i EU-LIFE, en allians av ledande biovetenskapliga forskningscentra i Europa.
Forskningsprogram
Bioinformatik och genomik
Det finns flera forskningslinjer inom bioinformatik och genomik. Genprediktion och modellering av splitsning är relaterad till forskningen om reglering av alternativ splitsning, reglering av proteinsyntes inom programmet för genreglering och programmet för gener och sjukdomar. En annan forskningslinje involverar identifiering och karakterisering av genomiska regioner associerade med genreglering. Detta är kopplat till forskning om kromatin och genuttryck, samt forskning om interaktioner mellan RNA-proteiner. Ännu en forskningslinje hänför sig till molekylär evolution, som inkluderar utvecklingen av den exoniska strukturen av gener och splitsning.
Inom detta program finns även en grupp som studerar mikroarrayer.
Programmet "Bioinformatik" är knutet till forskningsgruppen för biomedicinsk informatik (GRIB). I denna grupp befinner sig forskningslinjer inom molekylär modellering, proteinstrukturförutsägelse och komplexa system i sitt begynnande skede.
Cell- och utvecklingsbiologi
Cell- och utvecklingsbiologi, eller CDB, bygger på idén att cellen ska vara det primära fokuset för utvecklingsbiologin, och att en cell bör förstås i sammanhanget av sin "värd"-organism.
Eftersom principerna som ligger till grund för beteendet hos proteiner inom och över celler är dåligt förstådda, syftar CDB-programmet till att studera interaktionerna mellan intercellulära signalsystem och cytoskelettet. Ett annat mål är att förstå hur detta påverkar cellulär rumslig organisation och informationsbehandling. Metoder inkluderar flerdimensionella fenotyper grundade i genomik och proteomik.
Genreglering, stamceller och cancer
Programmet genreglering, stamceller och cancer fokuserar på mekanismer för genuttryck, mekanismer för epigenetisk reglering och den molekylära grunden för cellulära operationer som hänför sig till vävnadshomeostas och cancer. Studier av genreglering inkluderar organisationen och utvecklingen av det regulatoriska genomet, kromatinsammansättning och transkriptionsreglering medierad av steroidhormoner, epigenetiska mekanismer i leukemi och stamceller, reglering av periodisk splitsning och mRNA-translation, och genfunktion och epigenetisk omprogrammering i embryogenes och könsceller. . Stamcellsforskning inkluderar differentiering och transdifferentiering i det hematopoetiska systemet, somatisk cellomprogrammering och vävnadsregenerering.
Systembiologi
Systembiologisk forskning inkluderar dynamiska genreglerande nätverk och systemneurovetenskap. Några modeller som används är prokaryoter, cellinjer, C. elegans, Drosophila och möss.
Detta forskningsprogram kombinerar systematisk och kvantitativ datainsamling med beräkningsmodeller, med målet att upptäcka dynamisk förståelse av komplexa biologiska processer. Ett tvärvetenskapligt tillvägagångssätt tillämpas, eftersom fysiker, matematiker och datavetare förs samman. Några speciella ämnen för undersökning är: signaltransduktion, genreglerande nätverk, multicellulär mönstring, kemotaxi, systemneurovetenskap, utvecklingen av nätverk och effekten av stokastiskt brus på organismnivå.
Internationella projekt
Rekonstitution av cellpolaritet och axelbestämning i ett cellfritt system
Cellpolaritet är en förutsättning för flera grundläggande operationer i djurceller, såsom asymmetrisk celldelning och morfogenes. För båda dessa bestäms polarisering av samma uppsättning proteiner, kända som PAR-proteiner. Det är inte känt hur dessa proteiner sätter polaritet. Utredarna har föreslagit en dubbel metod, som kombinerar in vitro- och cellextrakttekniker. Målet är att få kunskap om det polariserande systemets beteende i mikrometerskala, såväl som dess komponenters attribut.
Metoder för högupplöst analys av generiska effekter på genuttryck
Många av de vanliga genetiska signalerna förknippade med sjukdom finns långt ifrån den DNA-sekvens som kodar för proteinsekvens. Det är troligt att de spelar en roll för att reglera genuttryck. I detta projekt utvecklar forskarna metoder som kommer att utforska effekterna av genetisk variation i genuttryck.
Detta program studerar stora förändringar i det moderna samhället och dess åtföljande risker. Detta projekt integrerar molekylära, cellulära, beräknings- och systembiologiska tillvägagångssätt i modellorganismer och mänskliga sjukdomar för att studera de genetiska orsakerna till åldersrelaterade sjukdomar. Ett syfte är att skapa nya diagnostiska och terapeutiska tekniker.
Kärnanläggningar
Avancerad ljusmikroskopienhet
Advanced Light Microscopy Unit tillhandahåller instrument som täcker hela tillämpningsspektrumet för avancerad ljusmikroskopi. Utrustning för provberedning och underhåll ligger under denna enhets ansvar. Support säkerställs också under bearbetning, rendering och analys av de förvärvade datamängderna.
Tillgänglig teknik omfattar: superupplösningsmikroskopi, tvåfotonmikroskopi, konfokalmikroskopi, total internreflektionsfluorescensmikroskopi, fluorescenslivstidsavbildningsmikroskopi, mikroinjektion, mikrodissektion, bildbehandling och analys och andra områden.
Bioinformatikenhet
Bioinformatikenheten ger forskare tjänster som konsultation, experimentplanering, databehandling, mjukvaru- och databasutveckling, bioinformatikutbildning och tillgång till högpresterande datorresurser.
Bland de tjänster som erbjuds är: provhantering och sekvensering, utveckling av bidragsförslag, variantdetektion inom genomik, kvalitetsbedömning av sammansättningar, analys av data med hög genomströmning, identifiering av mikrobiella och svampsamhällen från sekvenser och proteinfunktionell annotering.
Tissue Engineering Unit
Målet för Tissue Engineering Unit är att förse forskare med banbrytande teknologier för stamcellsbiologi, stamcellsdifferentiering, organoidbildning och inducerade pluripotenta stamceller. Denna enhet samarbetar med Biomolecular Screening & Protein Technologies Unit för genomredigeringstekniktjänster.
