Cathy H. Wu

Cathy H. Wu
Vetenskaplig karriär
Fält	Beräkningsbiologi Biokemi Onkologi Bioinformatik
institutioner	University of Delaware Georgetown University Medical Center

Cathy H. Wu är Edward G. Jefferson-ordförande och professor och chef för Center for Bioinformatics & Computational Biology (CBCB) vid University of Delaware . Hon är också chef för Protein Information Resource (PIR) och North East Bioinformatics Collaborative Steering Committee, och adjungerad professor vid Georgetown University Medical Center .

tidigt liv och utbildning

Wu är mellanbarnet av de fem döttrarna och en son i hennes familj. Hon svarade med toppbetyg vid National Taiwan University och visade en känsla för vetenskap, logik och beräkningar. Hennes far var flygingenjör . Hon tog examen med en BS i växtpatologi vid National Taiwan University 1978, en MS i växtpatologi vid Purdue University 1982 och följde med en doktorsexamen vid samma universitet 1984. Hon tog sedan en postdoc -examen i molekylärbiologi vid Michigan State University 1986 och en MS i datavetenskap vid University of Texas (UT) i Tyler 1989.

Karriär

1989 avslutade Wu sin avhandling om användningen av artificiella neurala nätverk för att klassificera proteiner och tog examen. Hennes avhandlingsrådgivare, George M. Witson III, ordförande för datavetenskapsavdelningen vid UT anställde henne efter att hon tog examen 1989. Hon undervisade sedan i datavetenskap som biträdande professor vid institutionen för datavetenskap i UT Tyler från 1989 till 1994. arbetade också som biträdande professor från 1990 till 1994, docent från 1994 till 1998 och professor från 1998 till 1999 vid Biomathematics University of Texas Health Center i Tyler. Hon utförde forskning vid UT Tylers hälsovetenskapshögskola under epidemiologi och biomatematikprofessor Jerry McClarty. Hon har bedrivit bioinformatikforskning från 1990 och utvecklat flera proteinklassificeringssystem och databaser. Hon ledde också stora programvaru- och databasprojekt som ledde bioinformatiksatsningen för Protein Information Resource (PIR) från 1999, och blev PIR-direktör och vicepresident för National Biomedical Research Foundation, Washington, DC från 2001 till 2002. Från 2001 till idag , hon är professor vid institutionen för biokemi och molekylärbiologi och chef för PIR Georgetown University Medical Center ( GUMC). Hon är också för närvarande professor vid institutionen för onkologi och medlem av Lombardi Comprehensive Cancer Center, GUMC från 2002. 2009 antogs Wu som Edward G. Jeffersons ordförande för bioinformatik och beräkningsbiologi vid University of Delaware (UD) ).

Utmärkelser beviljade

• 2020 - Fellow i Association for Computing Machinery (ACM)
• Juli 2012 till juni 2017 - 1144726, NSF/DGE, IGERT: Systems Biology of Cells in Engineered Environments (SBE2). Roll: Co-PI
• September 2011 till augusti 2015 - 2R01GM080646-06 & 3R01GM80646-07S1, NIH/NIGMS, PRO: A Protein Ontology in Open Biomedical Ontologies. Roll: PI
• Juli 2011 till juni 2015 - 1062520, NSF/DBI, ABI Development: Integrative Bioinformatics for Knowledge Discovery of PTM Networks. Roll: PI
• September 2011 till augusti 2014 - DOE/FOA-0000368, Experimental Systems-Biology Approaches for Clostridia-Based Bioenergy Production. Roll: Co-PI
• November 2009 till februari 2014 - 8P20GM103446, NIH/NIGMS, Delaware INBRE Roll: Bioinformatics Core Director
• Augusti 2010 till 2013 - 1G08 LM010720-01, NIH/NLM, Linking Text Mining and Data Mining for Biomedical Knowledge Discovery. Roll: PI
• September 2010 till juli 2013 - 1U41HG006104-01, NIH/NHGRI, UniProt: A Centralized Protein Sequence and Function Resource. Roll: Co-PI
• September 2009 till augusti 2012 - DBI-0850319, NSF/DBI, Linking Text Mining with Ontology and Systems Biology. Roll: PI
• Juni 2011 till maj 2012 - 1137427, NSF/IIS, III: Small: Women in Bioinformatics Initiative på ACM BCB 2011. Roll: Co-PI
• September 2009 till april 2012 - 3R01GM080646-04S2, NIH/NIGMS, Pro: A Protein Ontology in Open Biomedical Ontologies. Roll: PI

Böcker och publikationer

Böcker

• Bioinformatics for Comparative Proteomics (Methods in Molecular Biology), 19 november 2010, av Cathy H. Wu (redaktör), Chuming Chen (redaktör),   ISBN 978-1607619765
• Computational Biology and Genome Informatics, februari 2003, av Cathy H. Wu (författare), Paul P. Wang (författare), Jason TL Wang (redaktör),   ISBN 978-9812382573
• Neural Networks and Genome Informatics, Volym 1 (Methods in Computational Biology and Biochemistry), 5 oktober 2000, av CH Wu (redaktör), JW McLarty (redaktör),   ISBN 978-0080428000

Publikationer

• UniProt: ett nav för proteininformation. UniProt Consortium. Nucleic Acids Res. 28 januari 43 (Databasproblem) (2015)
•    Suzek, BE; Wang, Y; Huang, H; McGarvey, PB; Wu, CH (2014). "UniRef-kluster: ett omfattande och skalbart alternativ för att förbättra sökningar efter sekvenslikhet" . Bioinformatik . 31 (6): 926–32. doi : 10.1093/bioinformatics/btu739 . PMC 4375400 . PMID 25398609 .
•    Natale, DA; Arighi, CN; Blake, JA; Bult, CJ; Christie, KR; Cowart, J; D'Eustachio, P; Diehl, AD; Drabkin, HJ; Helfer, O; Huang, H; Masci, AM; Ren, J; Roberts, NV; Ross, K; Ruttenberg, A; Shamovsky, V; Smith, B; Yerramalla, MS; Zhang, J; AlJanahi, A; Çelen, I; Gan, C; Lv, M; Schuster-Lezell, E; Wu, CH (2014). "Proteinontologi: ett kontrollerat strukturerat nätverk av proteinenheter" . Nucleic Acids Res . 42 (Databasproblem): D415–21. doi : 10.1093/nar/gkt1173 . PMC 3964965 . PMID 24270789 .
•    Uniprot, Consortium (2014). "Aktiviteter på Universal Protein Resource (UniProt)" . Nucleic Acids Res . 42 (Databasutgåva): D191–8. doi : 10.1093/nar/gkt1140 . PMC 3965022 . PMID 24253303 .

externa länkar

• Informationsresurs för protein
• Center for Bioinformatics and Computational Biology, University of Delaware