Calumenin

CALU
Identifiers
	, calumenin
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Calumenin är ett protein som hos människor kodas av CALU -genen .

Calumenin (CALU) är ett kalciumbindande protein lokaliserat i det endoplasmatiska retikulum (ER) och är involverat i sådana ER-funktioner som proteinveckning och sortering . Calumenin är en medlem av EF-handsuperfamiljen i ER- och Golgi-apparaten som heter CERC. CERC är en akronym för dess familjemedlemmar Cab-45, reticulocalbin , Erc-55 ( RCN2 ) och calumenin. CALU-genen kodar för ett härlett protein med 315 aminosyror som innehåller 6 EF-handmotiv, 1 potentiellt N-glykosyleringsställe och en C-terminal ER-retentionssignal. Human- och mus-CALU-proteinerna är 98% identiska. CALU mRNA uttrycks överallt i mänskliga vävnader och mappar till 7q32.

externa länkar

• Mänskligt CALU- genomplacering och CALU- geninformationssida i UCSC Genome Browser .

Vidare läsning

•   Yabe D, Nakamura T, Kanazawa N, et al. (1997). "Calumenin, ett Ca2+-bindande protein kvar i det endoplasmatiska retikulumet med en ny karboxylterminalsekvens, HDEF" . J. Biol. Chem . 272 (29): 18232–9. doi : 10.1074/jbc.272.29.18232 . PMID 9218460 .
•   Vorum H, Liu X, Madsen P, et al. (1998). "Molekylär kloning av ett cDNA som kodar för humant calumenin, uttryck i Escherichia coli och analys av dess Ca2+-bindande aktivitet". Biochim. Biophys. Acta . 1386 (1): 121–31. doi : 10.1016/s0167-4838(98)00089-2 . PMID 9675259 .
•    Hseu MJ, Yen CH, Tzeng MC (1999). "Krokalbin: ett nytt kalciumbindande protein som också är ett bindande protein för krotoxin, ett neurotoxiskt fosfolipas A2" . FEBS Lett . 445 (2–3): 440–4. doi : 10.1016/S0014-5793(99)00177-5 . PMID 10094503 . S2CID 40129100 .
•   Vorum H, Hager H, Christensen BM, et al. (1999). "Humant kalumenin lokaliseras till den sekretoriska vägen och utsöndras till mediet". Exp. Cell Res . 248 (2): 473–81. doi : 10.1006/excr.1999.4431 . PMID 10222138 .
•    Vorum H, Jacobsen C, Honoré B (2000). "Calumenin interagerar med serumamyloid P-komponent". FEBS Lett . 465 (2–3): 129–34. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01734-2 . PMID 10631319 . S2CID 1943508 .
•    Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "DNA-kloning med användning av platsspecifik rekombination in vitro" . Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
•    Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). "Mot en katalog av mänskliga gener och proteiner: sekvensering och analys av 500 nya kompletta proteinkodande humana cDNAs" . Genome Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Basrur V, Yang F, Kushimoto T, et al. (2003). "Proteomisk analys av tidiga melanosomer: identifiering av nya melanosomala proteiner". J. Proteome Res . 2 (1): 69–79. doi : 10.1021/pr025562r . PMID 12643545 .
•    Gevaert K, Goethals M, Martens L, et al. (2004). "Utforska proteomer och analysera proteinbearbetning genom masspektrometrisk identifiering av sorterade N-terminala peptider". Nat. Biotechnol . 21 (5): 566–9. doi : 10.1038/nbt810 . PMID 12665801 . S2CID 23783563 .
•    Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR, et al. (2003). "Human kromosom 7: DNA-sekvens och biologi" . Vetenskap . 300 (5620): 767–72. Bibcode : 2003Sci...300..767S . doi : 10.1126/science.1083423 . PMC 2882961 . PMID 12690205 .
•   Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•    Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). "Från ORFeome till biologi: en funktionell genomikpipeline" . Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
•    Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Mot en karta i proteomskala över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket". Naturen . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
•   Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). "Signalsekvens och nyckelordsfälla i silico för urval av fullängds humana cDNA som kodar för sekretion eller membranproteiner från oligokapslade cDNA-bibliotek" . DNA Res . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743 .
•    Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). "LIFEdb-databasen 2006" . Nucleic Acids Res . 34 (Databasproblem): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .
•    Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et al. (2006). "Ett sannolikhetsbaserat tillvägagångssätt för högkapacitetsproteinfosforyleringsanalys och platslokalisering". Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
•   Chi A, Valencia JC, Hu ZZ, et al. (2007). "Proteomisk och bioinformatisk karakterisering av biogenes och funktion av melanosomer". J. Proteome Res . 5 (11): 3135–44. doi : 10.1021/pr060363j . PMID 17081065 .