Kalponin består huvudsakligen av α-helixar med vätebindningsvarv. Det är ett bindande protein och består av tre domäner. Dessa domäner i uppträdandeordning är Calponin Homology (CH), regulatorisk domän (RD) och Click-23, domän som innehåller kalponinupprepningarna . Vid CH-domänen binder kalponin till α-aktin och filamin och binder till aktin inom RD-domänen. Kalmodulin kan, när det aktiveras av kalcium, binda svagt till CH-domänen och hämma kalponinbindning med α-aktin. Calponin är ansvarigt för att binda många aktinbindande proteiner, fosfolipider, och reglerar aktin/myosin-interaktionen. Calponin tros också påverka bentillverkningsprocessen negativt på grund av att det uttrycks i höga mängder i osteoblaster .
