CTDP1

CTDP1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CCFDN, FCP1, CTD fosfatassubenhet 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

RNA-polymeras II-subenhet Fosfatas i en C-terminal domän är ett enzym som hos människor kodas av CTDP1 -genen .

Denna gen kodar för ett protein som interagerar med karboxiterminalen av transkriptionsinitieringsfaktorn TFIIF, en transkriptionsfaktor som reglerar förlängning såväl som initiering av RNA-polymeras II. Proteinet kan också representera en komponent i ett RNA-polymeras II-holoenzymkomplex. Alternativ splitsning av denna gen resulterar i två transkriptvarianter som kodar för 2 olika isoformer.

Interaktioner

CTDP1 har visats interagera med WD-repetitionsinnehållande protein 77 , GTF2F1 och POLR2A .

externa länkar

• Mänskligt CTDP1- genomplacering och CTDP1- geninformationssida i UCSC Genome Browser .

Vidare läsning

•    Scully R, Anderson SF, Chao DM, et al. (1997). "BRCA1 är en komponent i RNA-polymeras II-holoenzymet" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (11): 5605–10. Bibcode : 1997PNAS...94.5605S . doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . PMC 20825 . PMID 9159119 .
•   Marshall NF, Dahmus GK, Dahmus ME (1998). "Reglering av fosfatas i karboxylterminaldomän genom HIV-1-tat-protein" . J. Biol. Chem . 273 (48): 31726–30. doi : 10.1074/jbc.273.48.31726 . PMID 9822634 .
•    Cho H, Kim TK, Mancebo H, et al. (1999). "Ett proteinfosfatas fungerar för att återvinna RNA-polymeras II" . Genes Dev . 13 (12): 1540–52. doi : 10.1101/gad.13.12.1540 . PMC 316795 . PMID 10385623 .
•   Angelicheva D, Turnev I, Dye D, et al. (1999). "Medfödd grå starr ansiktsdysmorfism neuropati (CCFDN) syndrom: en ny utvecklingsstörning hos zigenare kartlägger till 18qter" . Eur. J. Hum. Genet . 7 (5): 560–6. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200319 . PMID 10439962 .
•   Marshall NF, Dahmus ME (2000). "C-terminal domän fosfataskänslighet av RNA-polymeras II i tidiga förlängningskomplex på HIV-1 och adenovirus 2 stora sena mallar" . J. Biol. Chem . 275 (42): 32430–7. doi : 10.1074/jbc.M005898200 . PMID 10938286 .
•    Licciardo P, Napolitano G, Majello B, Lania L (2001). "Hämning av Tat-transaktivering av RNA-polymeras II CTD-fosfatas FCP1". AIDS . 15 (3): 301–7. doi : 10.1097/00002030-200102160-00002 . PMID 11273209 . S2CID 33054695 .
•   Bharucha DC, Zhou M, Nekhai S, et al. (2002). "Ett proteinfosfatas från humana T-celler förstärker transaktiveringen av humant immunbristvirus typ 1 långterminal upprepning" . Virologi . 296 (1): 6–16. doi : 10.1006/viro.2002.1438 . PMID 12036313 .
•   Washington K, Ammosova T, Beullens M, et al. (2002). "Proteinfosfatas-1 defosforylerar den C-terminala domänen av RNA-polymeras-II" . J. Biol. Chem . 277 (43): 40442–8. doi : 10.1074/jbc.M205687200 . PMID 12185079 .
•    Mandal SS, Cho H, Kim S, et al. (2002). "FCP1, ett fosfatas specifikt för heptapeptidupprepningen av den största subenheten av RNA-polymeras II, stimulerar transkriptionsförlängning" . Mol. Cell. Biol . 22 (21): 7543–52. doi : 10.1128/MCB.22.21.7543-7552.2002 . PMC 135672 . PMID 12370301 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Licciardo P, Amente S, Ruggiero L, et al. (2003). "FCP1-fosfataset interagerar med RNA-polymeras II och med MEP50, en komponent av metylosomkomplexet som är involverat i sammansättningen av snRNP" . Nucleic Acids Res . 31 (3): 999–1005. doi : 10.1093/nar/gkg197 . PMC 149217 . PMID 12560496 .
•   Nguyen BD, Chen HT, Kobor MS, et al. (2003). "Lösningsstruktur för den karboxylterminala domänen av RAP74 och NMR-karakterisering av FCP1-bindningsställena för RAP74 och human TFIIB". Biokemi . 42 (6): 1460–9. doi : 10.1021/bi0265473 . PMID 12578358 .
•    Friedl EM, Lane WS, Erdjument-Bromage H, et al. (2003). "Den C-terminala domänens fosfatas- och transkriptionsförlängningsaktiviteter hos FCP1 regleras av fosforylering" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (5): 2328–33. Bibcode : 2003PNAS..100.2328F . doi : 10.1073/pnas.2628049100 . PMC 151340 . PMID 12591939 .
•    Kamada K, Roeder RG, Burley SK (2003). "Molekylär mekanism för rekrytering av TFIIF-associerande RNA-polymeras C-terminala domänfosfatas (FCP1) genom transkriptionsfaktor IIF" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (5): 2296–9. Bibcode : 2003PNAS..100.2296K . doi : 10.1073/pnas.262798199 . PMC 151334 . PMID 12591941 .
•    Nguyen BD, Abbott KL, Potempa K, et al. (2003). "NMR-struktur av ett komplex innehållande TFIIF-subenheten RAP74 och RNA-polymeras II-karboxylterminaldomänen fosfatas FCP1" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (10): 5688–93. Bibcode : 2003PNAS..100.5688N . doi : 10.1073/pnas.1031524100 . PMC 156262 . PMID 12732728 .
•    Varon R, Gooding R, Steglich C, et al. (2003). "Partiell brist på fosfataset i den C-terminala domänen av RNA-polymeras II är associerad med medfödd grå starr ansiktsdysmorfism neuropati syndrom". Nat. Genet . 35 (2): 185–9. doi : 10.1038/ng1243 . PMID 14517542 . S2CID 22461437 .
•    Yu X, Chini CC, He M, et al. (2003). "BRCT-domänen är en fosfoproteinbindande domän". Vetenskap . 302 (5645): 639–42. Bibcode : 2003Sci...302..639Y . doi : 10.1126/science.1088753 . PMID 14576433 . S2CID 29407635 .
•    Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .