CLK1

CLK1
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CLK, CLK/STY, STY, CDC-liknande kinas 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Dubbelspecificitetsproteinkinas CLK1 är ett enzym som hos människor kodas av CLK1 -genen .

Fungera

Denna gen kodar för en medlem av den CDC2-liknande (eller LAMMER) familjen av proteinkinaser med dubbla specificiteter . I cellkärnan fosforylerar det kodade proteinet serin / argininrika proteiner som är involverade i pre-mRNA-bearbetning, och släpper ut dem i nukleoplasman . Valet av splitsningsställen under pre-mRNA-bearbetning kan regleras av koncentrationen av transagerande faktorer, inklusive serin/argininrika proteiner. Därför kan det kodade proteinet spela en indirekt roll för att styra val av splitsningsställe.

Interaktioner

CLK1 har visats interagera med ASF/SF2 .

externa länkar

Human CLK1- genomplacering och CLK1- geninformationssida i UCSC Genome Browser .

Vidare läsning

Johnson KW, Smith KA (1991). "Molekylär kloning av ett nytt humant cdc2/CDC28-liknande proteinkinas" . J. Biol. Chem . 266 (6): 3402–7. doi : 10.1016/S0021-9258(19)67807-5 . PMID 1704889 .
Ben-David Y, Letwin K, Tannock L, Bernstein A, Pawson T (1991). "Ett däggdjursproteinkinas med potential för serin/treonin och tyrosinfosforylering är relaterat till cellcykelregulatorer" . EMBO J . 10 (2): 317–25. doi : 10.1002/j.1460-2075.1991.tb07952.x . PMC 452648 . PMID 1825055 .
Hanes J, von der Kammer H, Klaudiny J, Scheit KH (1995). "Karakterisering genom cDNA-kloning av två nya humana proteinkinaser. Bevis genom sekvensjämförelse av en ny familj av proteinkinaser från däggdjur". J. Mol. Biol . 244 (5): 665–72. doi : 10.1006/jmbi.1994.1763 . PMID 7990150 .
Colwill K, Pawson T, Andrews B, Prasad J, Manley JL, Bell JC, Duncan PI (1996). "Clk/Sty-proteinkinaset fosforylerar SR-splitsningsfaktorer och reglerar deras intranukleära distribution" . EMBO J . 15 (2): 265–75. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00357.x . PMC 449941 . PMID 8617202 .
Colwill K, Feng LL, Yeakley JM, Gish GD, Cáceres JF, Pawson T, Fu XD (1996). "SRPK1- och Clk/Sty-proteinkinaser visar distinkta substratspecificiteter för serin/argininrika splitsningsfaktorer" . J. Biol. Chem . 271 (40): 24569–75. doi : 10.1074/jbc.271.40.24569 . PMID 8798720 .
Nestel FP, Colwill K, Harper S, Pawson T, Anderson SK (1997). "RS-cyklofiliner: identifiering av en NK-TR1-relaterad cyklofilin". Gene . 180 (1–2): 151–5. doi : 10.1016/S0378-1119(96)00436-2 . PMID 8973360 .
Moeslein FM, Myers MP, Landreth GE (1999). "CLK-familjens kinaser, CLK1 och CLK2, fosforylerar och aktiverar tyrosinfosfataset, PTP-1B" . J. Biol. Chem . 274 (38): 26697–704. doi : 10.1074/jbc.274.38.26697 . PMID 10480872 .
Menegay HJ, Myers MP, Moeslein FM, Landreth GE (2000). "Biokemisk karakterisering och lokalisering av kinaset CLK1 med dubbel specificitet". J. Cell Sci . 113 (18): 3241–53. doi : 10.1242/jcs.113.18.3241 . PMID 10954422 .
Kojima T, Zama T, Wada K, Onogi H, Hagiwara M (2001). "Kloning av human PRP4 avslöjar interaktion med Clk1" . J. Biol. Chem . 276 (34): 32247–56. doi : 10.1074/jbc.M103790200 . PMID 11418604 .
Hartmann AM, Rujescu D, Giannakouros T, Nikolakaki E, Goedert M, Mandelkow EM, Gao QS, Andreadis A, Stamm S (2001). "Reglering av alternativ splitsning av humant tau-exon 10 genom fosforylering av splitsningsfaktorer". Mol. Cell. Neurosci . 18 (1): 80–90. doi : 10.1006/mcne.2001.1000 . PMID 11461155 . S2CID 18388526 .
Lai MC, Lin RI, Tarn WY (2003). "Differentiella effekter av hyperfosforylering på splitsningsfaktor SRp55" . Biochem. J . 371 (Pt 3): 937–45. doi : 10.1042/BJ20021827 . PMC 1223332 . PMID 12549978 .
Umehara H, Nishii Y, Morishima M, Kakehi Y, Kioka N, Amachi T, Koizumi J, Hagiwara M, Ueda K (2003). "Effekt av cisplatinbehandling på spräcklig distribution av ett serin/argininrikt nukleärt protein CROP/Luc7A". Biochem. Biophys. Res. Commun . 301 (2): 324–9. doi : 10.1016/S0006-291X(02)03017-6 . PMID 12565863 .
Kantham L, Kerr-Bayles L, Godde N, Quick M, Webb R, Sunderland T, Bond J, Walder K, Augert G, Collier G (2003). "Beacon interagerar med cdc2/cdc28-liknande kinaser". Biochem. Biophys. Res. Commun . 304 (1): 125–9. doi : 10.1016/S0006-291X(03)00549-7 . PMID 12705895 .
Prasad J, Manley JL (2003). "Reglering och substratspecificitet för SR-proteinkinas Clk/Sty" . Mol. Cell. Biol . 23 (12): 4139–49. doi : 10.1128/MCB.23.12.4139-4149.2003 . PMC 156123 . PMID 12773558 .
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). "En ouppskattad roll för RNA-övervakning" . Genome Biol . 5 (2): R8. doi : 10.1186/gb-2004-5-2-r8 . PMC 395752 . PMID 14759258 .
Muraki M, Ohkawara B, Hosoya T, Onogi H, Koizumi J, Koizumi T, Sumi K, Yomoda J, Murray MV, Kimura H, Furuichi K, Shibuya H, Krainer AR, Suzuki M, Hagiwara M (2004). "Manipulation av alternativ skarvning av en nyutvecklad hämmare av Clks" . J. Biol. Chem . 279 (23): 24246–54. doi : 10.1074/jbc.M314298200 . PMID 15010457 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). "Mot en proteomskalakarta över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket". Naturen . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Velazquez-Dones A, Hagopian JC, Ma CT, Zhong XY, Zhou H, Ghosh G, Fu XD, Adams JA (2006). "Masspektrometrisk och kinetisk analys av ASF/SF2-fosforylering genom SRPK1 och Clk/Sty" . J. Biol. Chem . 280 (50): 41761–8. doi : 10.1074/jbc.M504156200 . PMID 16223727 .